rserve php,RServe简介

前言

Rserve作为一个R语言与其他语言的通信(TCP/IP)接口，被多个项目所依赖。Rserve服务端配置和运行都非常简单，客户端由多种语言实现，像C/C++, Java等。R也有自己的客户端实现 RSclient 项目。

Rserve介绍

Rserve是一个基于TCP/IP协议的，允许R语言与其他语言通信的C/S结构的程序，支持C/C++,Java,PHP,Python,Ruby,Nodejs等。 Rserve提供远程连接，认证，文件传输等功能。我们可以设计R做为后台服务，处理统计建模，数据分析，绘图等的任务。

Rserve安装

服务器系统环境Linux: Ubuntu 12.04.2 LTS 64bit

R: 3.0.1 x86_64-pc-linux-gnu

Rserve安装和加载~ R

> install.packages("Rserve")

> library(Rserve)

Rserve服务器1). 在程序中，启动Rserve服务器

2). 在命令行，启动Rserve服务器

Rserve的函数，只有3个。Rserve(): 单独启动一个守护进程作为Rserve实例。

run.Rserve(): 在当前的进程中，启动Rserve实例

self():

1). 在程序中，启动Rserve服务器> library(Rserve)

> Rserve()

Starting Rserve:

/usr/lib/R/bin/R CMD /home/conan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rserve/libs//Rserve

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"

Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing

Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.

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'help.start()' for an HTML browser interface to help.

Type 'q()' to quit R.

Rserv started in daemon mode.

查看Rserv进程~ ps -aux|grep Rserve

conan     8830  0.0  1.2 116336 25044 ?        Ss   06:46   0:00 /home/conan/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/Rserve/libs//Rserve

~ netstat -nltp|grep Rserve

tcp        0      0 127.0.0.1:6311          0.0.0.0:*               LISTEN      8830/Rserve

2). 在命令行，启动Rserve服务器

Rserve命令帮助~ R CMD Rserve --help

Usage: R CMD Rserve []

Options: --help  this help screen

--version  prints Rserve version (also passed to R)

--RS-portlisten on the specified TCP port

--RS-socketuse specified local (unix) socket instead of TCP/IP.

--RS-workdiruse specified working directory root for connections.

--RS-encodingset default server string encoding to.

--RS-confload additional config file.

--RS-settings  dumps current settings of the Rserve

--RS-sourcesource the specified file on startup.

--RS-enable-control  enable control commands

--RS-enable-remote  enable remote connections

All other options are passed to the R engine.

在命令行启动Rserve~ R CMD Rserve --RS-enable-remote

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"

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'help.start()' for an HTML browser interface to help.

Type 'q()' to quit R.

Rserv started in daemon mode.

查看Rserv进程~ ps -aux|grep Rserve

conan    27639  0.0  1.2 116288 25236 ?        Ss   20:41   0:00 /usr/lib/R/bin/Rserve --RS-enable-remote

~ netstat -nltp|grep Rserve

tcp        0      0 0.0.0.0:6311            0.0.0.0:*               LISTEN      27639/Rserve

3. Rserve高级使用：Rserve配置管理

通过配置文件，管理Rserve服务器。Rserv.conf: 配置文件

source.R:初始化脚步文件

查看当前的Rserve 服务器的默认配置信息~ R CMD Rserve --RS-settings

Rserve v1.7-1

config file: /etc/Rserv.conf

working root: /tmp/Rserv

port: 6311

local socket: [none, TCP/IP used]

authorization required: no

plain text password: not allowed

passwords file: [none]

allow I/O: yes

allow remote access: no

control commands: no

interactive: yes

max.input buffer size: 262144 kBconfig file: 我本地无此文件/etc/Rserv.conf, 系统会默认跳过这项

working root: R运行时工作目录 /tmp/Rserv

port: 通信端口6311

local socket: TCP/IP协议

authorization: 认证未开启

plain text password: 不允许明文密码

passwords file: 密码文件，未指定

allow I/O: 允许IO操作

allow remote access: 远程访问未开启

control commands: 命令控制未开启

interactive: 允许通信

max.input buffer size: 文件上传限制262mb

修改默认配置，新建文件：/etc/Rserv.conf~ sudo vi /etc/Rserv.conf

workdir /tmp/Rserv

remote enable

fileio enable

interactive yes

port 6311

maxinbuf 262144

encoding utf8

control enable

source /home/conan/R/RServe/source.R

eval xx=1

~ vi /home/conan/R/RServe/source.R

cat("This is my Rserve!!")

print(paste("Server start at",Sys.time()))

再次查看服务器配置R CMD Rserve --RS-settings

Rserve v1.7-1

config file: /etc/Rserv.conf

working root: /tmp/Rserv

port: 6311

local socket: [none, TCP/IP used]

authorization required: yes

plain text password: allowed

passwords file: [none]

allow I/O: yes

allow remote access: yes

control commands: yes

interactive: yes

max.input buffer size: 262144 kB允许远程访问

需要登陆认证

允许明文密码

启动服务器~  R CMD Rserve

R version 3.0.1 (2013-05-16) -- "Good Sport"

Copyright (C) 2013 The R Foundation for Statistical Computing

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R is free software and comes with ABSOLUTELY NO WARRANTY.

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Natural language support but running in an English locale

R is a collaborative project with many contributors.

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'citation()' on how to cite R or R packages in publications.

Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or

'help.start()' for an HTML browser interface to help.

Type 'q()' to quit R.

This is my Rserve!![1] "Server start at 2013-10-30 22:38:10"

Rserv started in daemon mode.

查看日志：source.R在启动时候被执行。"This is my Rserve!![1] "Server start at 2013-10-30 22:38:10""

source选项，用来配置Rserve服务器启动时加载的文件，例如：初始化系统变量，初始化系统函数等。eval选项，直接定义环境变量。

查看进程~ ps -aux|grep Rserve

conan    28339  0.0  1.2 116292 25240 ?        Ss   22:31   0:00 /usr/lib/R/bin/Rserve

~ netstat -ntlp|grep Rserve

tcp        0      0 0.0.0.0:6311            0.0.0.0:*               LISTEN      28339/Rserve

允许远程访问, 不限制IP0 0.0.0.0:6311

4. Rserve高级使用：用户登陆认证

在本地环境，无认证情况下，使用RSclient访问Rserve。RSclient的使用，请参考文章：Rserve的R语言客户端RSclient~ R

>  library(RSclient)

>  conn

>  RS.eval(conn,rnorm(10))

[1]  0.03230305  0.95710725 -0.33416069 -0.37440009 -1.95515719 -0.22895924

[7]  0.39591984  1.67898842 -0.01666688 -0.26877775

增加用户登陆认证，修改文件：/etc/Rserv.conf~ sudo vi /etc/Rserv.conf

workdir /tmp/Rserv

remote enable

fileio enable

interactive yes

port 6311

maxinbuf 262144

encoding utf8

control enable

source /home/conan/R/RServe/source.R

eval xx=1

auth required

plaintext enable

使用RSclient访问，认证报错。> library(RSclient)

> conn

> RS.eval(conn,rnorm(10))

Error in RS.eval(conn, rnorm(10)) :

command failed with status code 0x41: authentication failed

用RSclient登陆> library(RSclient)

> conn

> RS.login(conn,"conan","conan",authkey=RS.authkey(conn))

[1] TRUE

> RS.eval(conn,rnorm(5))

[1] -1.19827684  0.72164617  0.22225934  0.09901505 -1.54661436

这里用户登陆认证，是绑定的操作系统用户。我们还可以在Rserv.conf配置文件，指定uid,gid参数，从而更细粒度的控制服务器权限。