生物信息分析服务器平台,高通量数据生物信息分析平台

摘要：

真菌室生物信息学平台经过三年建设期,针对真菌和原核生物等微生物高通量测序数据,涵盖了功能基因组、比较基因组、转录组和系统生物学等全方位丰富的专业分析流程,目前已构建成国内先进的微生物数据专业分析平台,并建立对外服务、共享资源的合作模式。硬件平台为具有632个计算核心、两个高配置胖节点服务器(512G内存/54CPU)、80T硬盘的高性能计算集群系统,软件平台包括原始数据质控、基因组组装、基因组注释、蛋白编码基因的预测、基因功能注释、同源基因分析、全基因组进化、水平转移基因的鉴定、蛋白质家族进行分析、比较基因组学分析、SV/CNV/Indel分析、时间序列表达谱分析、系统生物学整合分析等内容。已完成20多个从头测序的真菌和放线菌基因组和转录组分析,及上百例重测序基因组微进化分析,合作发表SCI论文8篇。对外合作主要有平台终端共享、数据常规分析、和项目个性化分析紧密合作三种模式。已建立项目个性化分析紧密合作关系的单位包括,中国检疫检验科学研究院、中国农业大学、福建农林大学、贵州省农业科学院、中国农业科学院农产品加工所、北京林业大学等。平台网址:http://bioinfor.amcfungi.org

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