这是个权限问题。
直接打开一个文件的话,或者没有使用sudo打开一个文件时,是当前用户在使用gedit,而gedit是属于root的,所以不能修改gedit,
在/home/your uesrname/.config/gedit 地方,使用chown命令修改为所属用户,获得权限即可
sudo chown YOUR_USERNAME /home/YOUR_USERNAME/.config/gedit
原帖:http://askubuntu.com/questions/489453/manage-external-tools-not-popping-up-dialog (需FQ)