我想尝试如何从R markdown文件渲染html,但是从作为Cron作业运行的bash脚本中渲染.我不知道为什么一切正常,除了作为Cron工作运行.我所做的:
我的脚本是Rstudio的演示脚本
---
title: "test"
author: "sms"
date: "24 maja 2015"
output: html_document
---
This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see .
When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
```{r}
summary(cars)
```
etc.
这个脚本在Rstudio中没有任何问题.
接下来我尝试从终端运行Rmd脚本:
Rscript -e "require( 'rmarkdown' ); render('/home/sms/Dokumenty/R/test.Rmd', 'html_document')"
没有任何问题.有用.
所以我创建了bash脚本
#!/bin/bash
Rscript -e“require(‘rmarkdown’); render(‘/ home / sms / Dokumenty / R / test.Rmd’,’html_document’)”
并更改了chmod 755 test.sh
也像魅力一样.
但是当放入Cron文件(管理员和用户)时:
28 18 * * * sh /home/sms/Dokumenty/R/test.sh
它不起作用
知道我做错了什么吗?