物化实验计算机量子化学计算,量子化学计算实验详解.pdf

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量子化学计算实验详解.pdf5页

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量子化学计算方法及应用

吴景恒

实验目的：

(1)掌握Gaussian03W 的基本操作

(2 )掌握 Gaussian03W 进行小分子计算的方法，比较不同方法与基组对计算结果的影响，并比较同分异构体的稳定性

(3 )通过运用量子力学方法计算分子的总电子密度，自旋密度，分子轨道及静电势

实验注意：

(1)穿实验服 ；实验记录用黑色，蓝色或蓝黑色钢笔或签字笔记录；实验数据记录不需要画表格

(2 )实验前请先仔细阅读 前面的软件使用介绍，然后逐步按照实验步骤所写内容进行操作

(3 )截图方法：调整视角至分子大小适中，按下键盘上的 PrintScreen 按键截图，从“Windows 开始菜单”打开“画图”工具

按 Ctrl+v 或“编辑-粘贴”，去掉四周多余部分只留下分子图形，保存图片

(4 )所有保存的文件全部存在 E 盘或 D 盘根目录用自己学号命名的文件夹下，不要带中文命名，实验完毕全部删

除，不得在计算用机上使用自己携带的 U 盘或其他便携存储设备！

(5 )HyperChem 里面截图时候可以用工具栏以下几个工具调整视图：

Rotate out-of-plane ：平面外旋转工具，转换视角用

Mgnify/Shrink ：放大镜工具，转换视角用

Gaussian03W 使用介绍：(注意，下面只是界面示意图，实验時切勿按下图设置)

输入文件：Gaussian 输入文件，以 GJF 为文件后缀名

联系命令行：设定中间信息文件(以 CHK 为后缀名)存放的位置、计算所需的内存、CPU 数量等

作业行：指定计算的方法，基组，工作类型，如：#P HF/6-31G(d) Scf=tight Opt Pop=full

# 作业行开始标记

P 计算结果显示方式为详细， 选择还有 T (简单)和 N (常规，默认)

HF/6-31G(d) 方法/基组

Opt 对分子做几何优化

Pop=full 进行轨道布居分析，详尽输出轨道信息和能量

电荷 多重态：分子总电荷及自旋多重态(2S+1, S=n/2, n 为成单电子数)

分子结构的表示

1、直角坐标：元素符号 X 坐标 Y 坐标 Z 坐标 (如上图所示)

2、Z 矩阵(参考后附内容)：元素符号(原子一) 原子二 键长 原子三 键角 原子四 二面角

GaussView 使用介绍：

主窗口 (左)，分子窗口 (中)原子片段窗口 (右)：

实验步骤：

一、计算准备

打开 GaussView ，在新建的分子窗口中画出给定的分子 点击右键选择 Lables 显示原子序号

点击File – Save... 把分子保存为 mol.gjf 文件； 用记事本打开 mol.gjf 文件，根据分子的对称性修改分子的 Z 矩阵

为相同环境的原子设置相同的键长并给出名称及初始值 ，如丙二烯的初始 Z-矩阵：

C

C 1 B1

H 2 B2 1 A1

H 2 B3 1 A2 3 D1

C 4 B4 2 A3 1 D2

H 5 B5 4 A4 2 D3

H 5 B6 4 A5

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