安装R包显示无法访问服务器,ubuntu服务器解决方案第二讲-R程序包最新版的安装...

发现自己搞服务器遇到的困难还是蛮多的，所以记录了一下，给菜鸟们指个路。

ubuntu对生信菜鸟来说是最好用的linux服务器，没有之一，因为它有apt-get。

首先，如果你的服务器里面有旧的R，那么删除Linux Ubuntu系统中原有的R软件包，代码如下：

sudo apt-get autoremove r-base-core # 删除系统中原有的R软件包

接下来，随便找到一个Ubuntu的软件源镜像

(http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/bin/linux/ubuntu/ )

因为看我教程的大部分在国内，所以我拿北京大学举例子。

PS(2017/12/20, 没想到随便找到来一个，就挂掉了，唉：

)

Linux Ubuntu 12.04对应的名字是 precise，

ubuntu14.04，那么就应该是 trusty

ubuntu15.04 ，其代号为 vivid

Ubuntu 16.04 LTS，代号为Xenial Xerus(非洲的一种地松鼠)，于UTC时间2016年4月21日正式发布。

比如我的Ubuntu 12.04就需要进入到 precise/目录，找到r-base-core相关的文件，发现有多个R的版本。

把这个软件源，增加到apt的sources.list文件中，代码如下：

deb http://mirror.bjtu.edu.cn/cran/bin/linux/ubuntu precise/

其余的ubuntu版本类似即可：

在/etc/apt/sources.list文件最下面，新加一行

~ sudo apt-get update # 更新源

~ sudo apt-get install r-base-core # 再次安装R语言软件包

~ R –version # 检查R的版本

这时我们就安装了最新的R语言版本—3.0.3版。

require(ggplot2)

Loading required package: ggplot2

Failed with error: ‘package ‘ggplot2’ was built before R 3.0.0: please re-install it’

这个失败原因是怎么回事？R 3.0.0 的问题吗？怎么解决？

R 2.x 升级 3.x 需要重新(编译)安装所有包：

update.packages(checkBuilt = TRUE, ask = FALSE)

当然如果你不是在R里面用install.package来安装包的话

你还需要

sudo apt-get install r-base-dev

这样你才能从源代码编译R的包

但是如果你导入的R源被你的服务器拒绝，你就惨了

The following signatures couldn't be verified because the public key is not

以下签名不能因为公钥未验证