1. 温故知坑
实践是学习知识的最好途径。之前我讲的内容都非常非常基础,包括:
(1)什么是R语言?R语言和Rstudio软件的安装,Rstudio的界面介绍;
(2)R语言的基本逻辑,基本数据类型;
(3)ggplot基础绘图;
(4)学习R语言的思路(整理,总结问题)。
通过不断的踩坑,走弯路,我们可以在勤奋的基础上,找一些快速的方法。我们已经不能再像上大学时候一样了,先啃完一本书,学好各种基础知识,然后开始应用。工作之繁忙,生活之琐碎,各种被电子产品占据走的时间。已经很难找出一整块的时间去学习了。
换句话说,没有目的性的理论学习就是耍流氓。怎么讲这么多数据类型,格式,可是我用不着呀?因此,我们调整策略,按照完成project为主线来解说在完成数据分析的过程中,我们需要用的R语言知识。
2. 一个超级简单的project流程
以我之前处理的GEO数据为蓝本,我们详细的介绍每一个数据处理过程,所需要的知识(不仅仅是R语言代码,还有各种背景知识)。
步骤基本上是:导入数据--整理为可以进行分析的形式--差异分析(火山图等)--GO/KEGG注释(各种好看的图)。其中每一个步骤都可以说是好几把辛酸泪。
但素!为了降低炸毛的风险,我自己捏造了一段非常非常小的数据用来做示例。想要跟着我步骤的小伙伴,需要这小小数据,你们可以想办法找到我。
so,今天我们来讲,导入数据!
(1)首先自然是要有数据