![cf5521fc61bf6e9fa1d3ddca5d4b3631.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/81dd9b1545587bd43ca0729233b2700e.jpeg)
最近在做这个,也不是很会,就当是记录一点学习心得了;如果有错误的地方,请指正。哈哈。
1.如何使用MEGA创建进化树?
古话说得好,巧妇难为无米之炊(我还想补充一句,巧妇也难为无灶之炊),嘛意思,就是我们首先要准备好自己的序列,当然还有MEGA软件。
1.1序列处理
比对之前,我已经把序列做成了自己想要的样子,主要是名字,名字,名字(懒得后面改了,本文也会说到怎么批量修改ID)
![e1f522dd2113dd4fd5a784e42a42ebff.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/e082723a2b40b30ee3dab152e9f8e3b6.jpeg)
输完序列,当然要保存文件啦,这里我们把记事本文件保存为fasta:文件—另存—保存类型(所有文件)—文件名(XXXXX.fasta)—保存
1.2打开MEGA建树
![e903e2fb2b2efa2ed5ad86ec8f748457.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/abc93b52017c9ad124251020eee80c43.jpeg)
选择Open A File ,打开刚刚保存的fasta文件。
![2e2c3cdfe445704ddf7d1ee146da9174.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/8a0a27968fc5bcc78f5e0f7da237b53f.jpeg)
![d369a55907970bd7acfd80ea87b1eb5d.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/59991dd5f6f1229d0a23f452901c9e83.jpeg)
之后选择Alignment---Align by clustalW----Select all