pku 2778 DNA Sequence AC自动机 + 矩阵

http://poj.org/problem?id=2778

题意:

给定n个病毒DNA串,求一个长度为m的DNA片段不包含任何一个病毒串的的可能数?

思路:
首先根据n个DNA串构造AC自动机,然后根据AC自动机构造矩阵,然后转化到Matrix大神的是个利用举证解决的问题的例八中去。

才开始我一直以为推出的举证和斐波那契数列的意思一样,转了个死弯,这里是把AC自动机这个图转化为邻接矩阵,然后求从一个状态到另一个状态经过m条边的的可能数。这个通过AC自动机得到的矩阵其实就是一个关系矩阵。

这里借鉴了一下胡浩大神的AC自动机模板:

//#pragma comment(linker,"/STACK:327680000,327680000")
#include <iostream>
#include <cstdio>
#include <cmath>
#include <vector>
#include <cstring>
#include <algorithm>
#include <string>
#include <set>
#include <functional>
#include <numeric>
#include <sstream>
#include <stack>
#include <map>
#include <queue>

#define CL(arr, val)    memset(arr, val, sizeof(arr))

#define lc l,m,rt<<1
#define rc m + 1,r,rt<<1|1
#define pi acos(-1.0)
#define ll __int64
#define L(x)    (x) << 1
#define R(x)    (x) << 1 | 1
#define MID(l, r)   (l + r) >> 1
#define Min(x, y)   (x) < (y) ? (x) : (y)
#define Max(x, y)   (x) < (y) ? (y) : (x)
#define E(x)        (1 << (x))
#define iabs(x)     (x) < 0 ? -(x) : (x)
#define OUT(x)  printf("%I64d\n", x)
#define lowbit(x)   (x)&(-x)
#define Read()  freopen("din.txt", "r", stdin)
#define Write() freopen("dout.txt", "w", stdout);


#define M 150
#define N 1007
using namespace std;

const int MAX_NODE = 107;
const int CHILD_NUM = 4;
const int mod = 100000;

int n,m;
int sz;

struct Mat
{
    ll mat[MAX_NODE][MAX_NODE];
    void init()
    {
        CL(mat,0);
    }
}a;

Mat operator*(Mat a,Mat b)
{
    Mat c;
    int i,j,k;
    CL(c.mat,0);
    for (i = 0; i < sz; ++i)
    {
        for (j = 0; j < sz; ++j)
        {
            for (k = 0; k < sz; ++k)
            {
                if (!a.mat[i][k] || !b.mat[k][j]) continue;
                c.mat[i][j] += a.mat[i][k]*b.mat[k][j];
                if (c.mat[i][j] >= mod) c.mat[i][j] %= mod;
            }
        }
    }
    return c;
}
Mat operator^(Mat a,int k)
{
    Mat c;
    int i,j;
    for (i = 0; i < sz; ++i)
    {
        for (j = 0; j < sz; ++j)
        {
            c.mat[i][j] = (i == j);
        }
    }
    while (k)
    {
        if (k&1) c = c*a;
        k >>= 1;
        a = a*a;
    }
    return c;

}
class ACautomaton
{
    public:
    int chd[MAX_NODE][CHILD_NUM];
    int fail[MAX_NODE];
    int ID[128];
    int val[MAX_NODE];
    int Q[MAX_NODE];


    void Init()
    {
        fail[0] = 0;
        val[0] = 0;
        ID['A'] = 0; ID['G'] = 1;
        ID['C'] = 2; ID['T'] = 3;
    }
    void Reset()
    {
        CL(chd[0],0);
        sz = 1;
    }
    void insert(char *s,int key)
    {
        int k;
        int p = 0;
        for (; *s; s++)
        {
            k = ID[(int)*s];
            if (!chd[p][k])
            {
                CL(chd[sz],0);
                val[sz] = 0;
                chd[p][k] = sz++;
            }
            p = chd[p][k];
        }
        val[p] = 1;
    }
    void build()
    {
        int i;
        int *s = Q,*e = Q;
        for (i = 0; i < CHILD_NUM; ++i)
        {
            if (chd[0][i])
            {
                fail[chd[0][i]] = 0;
                *e++ = chd[0][i];
            }
        }
        while (s != e)
        {
            int u = *s++;
            for (i = 0; i < CHILD_NUM; ++i)
            {
                int &v = chd[u][i];
                if (v)
                {
                    *e++ = v;
                    fail[v] = chd[fail[u]][i];
                    val[v] |= val[fail[v]];
                }
                else
                {
                    v = chd[fail[u]][i];
                }
            }
        }
    }
    void Work()
    {
        int i,j;
        a.init();
        for (i = 0; i < sz; ++i)
        {
            if (val[i]) continue;
            for (j = 0; j < CHILD_NUM; ++j)
            {
                if (val[chd[i][j]]) continue;
                a.mat[i][chd[i][j]]++;
            }
        }
        Mat res;
        res = a^m;
        ll ans = 0;
        for (i = 0; i < sz; ++i)
        {
            if (val[i]) continue;
            ans += res.mat[0][i];
            ans %= mod;
        }
        printf("%I64d\n",ans%mod);
    }
}ac;

char str[15];

int main()
{
    int i;
    while (~scanf("%d%d",&n,&m))
    {
        ac.Init();
        ac.Reset();
        for (i = 0; i < n; ++i)
        {
            scanf("%s",str);
            ac.insert(str,1);
        }
        ac.build();
        ac.Work();
    }
    return 0;
}

  

 

 

  • 0
    点赞
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论

“相关推荐”对你有帮助么?

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值