根目录一般不含任何文件，除了可能的标准的系统引导映象，通常叫 /vmlinuz 。所有其他文件在根文件系统的子目录中。

/bin
引导启动所需的命令或普通用户可能用的命令 ( 可能在引导启动后 ) 。
/sbin
类似 /bin ，根用户用天用于管理的执行程序。
/etc
存放与系统硬件和软件有关的所有配置文件
/root
root 用户的主目录。
/lib 
 存放内核与应用程序所用的库文件和模块，包括各种硬件的驱动程序  
/lib/modules
核心可加载模块，特别是那些恢复损坏系统时引导所需的 ( 例如网络和文件系统驱动 ) 。
/dev
存放系统中所有设备的设备名
/tmp
临时文件。引导启动后运行的程序应该使用 /var/tmp ，而不是 /tmp ，因为前者可能在一个拥有更多空间的磁盘上。
/boot
引导加载器 (bootstrap loader) 使用的文件，如 LILO 。核心映象也经常在这里，而不是在根目录。如果有许多核心映象，这个目录可能变得很大，这时可能使用单独的文件系统更好。另一个理由是要确保核心映象必须在 IDE 硬盘的前 1024 柱面内。
/mnt
系统管理员临时 mount 的安装点。程序并不自动支持安装到 /mnt 。 /mnt 可以分为子目录 ( 例如 /mnt/dosa 可能是使用 MSDOS 文件系统的软驱，而 /mnt/exta 可能是使用 ext2 文件系统的软驱 ) 。
/proc
内存文件系统，对系统的诊断非常重要
 /usr
与用户有关程序，或者用户安装的其他应用程序
 /var
系统运行过程中文件内容会发生变化的目录，主要包括mail目录，各种服务器的数据文件，日志文件等等
/home
存放普通用户的主目录