linux输入qsub显示错误,bash – 如何在qsub中指定错误日志文件和输出文件

这篇博客介绍了如何在PBS作业提交系统中通过qsub命令或脚本注释来指定错误日志和输出文件的位置。第一种方法是在PBS脚本中使用特定的指令,但可能无法使用变量。第二种方法是在调用qsub时直接提供选项。第三种方法是在脚本内部直接重定向输出和错误到指定文件,这种方法更简洁。无论哪种方式,都能确保作业的输出和错误信息得到妥善管理。
摘要由CSDN通过智能技术生成

通常,错误和输出文件以qsub脚本中的pbs指令或qsub脚本的命令行选项的形式给出,如下所示:

#! /bin/bash

#PBS -q queue_name

#PBS -A account_name

#PBS -l nodes=12:ppn=12

#PBS -l walltime=18:00:00

#PBS -e /mypath/error.txt

#PBS -o /mypath/output.txt

或者作为qsub的命令行选项,就像这样:

qsub -o /mypath/output.txt -e /mypath/error.txt submit_job.sh

使用第一个选项,我不认为你可以使用一个变量,因为shell不会看到被注释的行。另外我认为PBS会在shell之前处理注释行。如果您在调用qsub时知道路径,可以尝试第二个选项。

或者,您可以尝试简单地重定向脚本本身的输出和错误:

/home/user1/run.sh $SEED > ${SEED}/output.txt 2> ${SEED}/error.txt

第三个选项可能是最简单的。输出和错误文件仍可能在运行目录中创建,尽管它们可能为空。

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