本文介绍了如何在Java环境中利用fit工具进行16s数据分析，特别是门（L2水平）的差异分析，并展示了如何生成差异气泡图。通过提供的完整代码示例，读者可以修改文件以适用于不同分类水平的分析。文章还分享了用于生成气泡图的R代码，包括数据过滤、贝叶斯检验和ggplot2作图过程。
对otu的差异分析并不是我们唯一的选择，差异往大的做，可以往往门，纲，目，科做。
今天要做一张长的图，我们可以和别的图一起配合使用会好？
比如这篇文章，还是挺好看的：
下面是一份完整的代码，我仅仅只做了L2水平，也就是门水平，大家修改文件，即可完整做其他水平的气泡图
全套代码和文件，大家修改文件名即可重复结果
链接：https://pan.baidu.com/s/15Zxbl9Rgk372Lv_w2hEbDg 密码：fwk9
setwd("E:/Shared_Folder/HG_kangbing/nobac_noqianheti_chuli")
design =read.table("map_HG_kangbing_R.txt", header=T, row.names= 1,sep="\t")
head(design)
setwd("E:/Shared_Folder/HG_kangbing/nobac_noqi
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