计算机化学 质量管理 高分子化学,不同类型亲水性结构表面修饰的聚氨酯材料与凝血十二因子九肽片段及纤维蛋白原料与凝血二十因子九肽片段及纤维蛋白原p1片段相互作用的计算机模拟化学;高分子化学与物理专业论文...

不同类型亲水性结构表面修饰的聚氨酯材料与凝血十二因子九肽片段及纤维蛋白原料与凝血二十因子九肽片段及纤维蛋白原p1片段相互作用的计算机模拟化学;高分子化学与物理专业论文

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摘要

分子动力学作为从理论上研究复杂分子体系的最直接方法之一，特别适合用 来模拟蛋白质与材料表面相互作用体系。本文使用分子动力学软件Discovery Studio 2．1，在隐性溶剂环境下，以凝血十二因子九肽片段、纤维蛋白原片段作 为研究对象，对蛋白质(片段)与不同类型亲水性结构修饰的聚氨酯材料表面相 互作用体系进行分子动力学模拟。同时，将单独蛋白质(片段)体系的分子动力 学模拟作为蛋白质(片段)的自然状态，供其他蛋白质(片段)与材料表面相互 作用体系进行对比。通过比较相关参数(如二面角分布、均方根偏移等)，得出 材料表面组成、结构与被吸附蛋白质的构象变化的关系，从而验证“维持自然状 态说"的合理性，为新型抗凝血高分子材料的设计、材料制备过程中工艺方法的 选择和加工工艺参数的控制提供理论依据。

本文从分子水平上提供蛋白质(片段)与材料表面相互作用的细节，研究不 同材料表面对蛋白质(片段)自然状态造成的影响。对上述不同体系进行分子动 力学模拟的结果显示，甲基丙烯酸羟乙酯(HEMA)亲水性结构修饰的聚氨酯材料 表面对蛋白质(片段)自然状态的维持程度最好，且预测HEMA亲水性结构在 聚氨酯材料表面的最佳接枝率为75％．100％。尽管完全验证“维持自然状态"说

还必须对完整的血液蛋白与更为真实的亲水结构材料表面相互作用体系进行分 子动力学模拟，但本文的工作仍为“维持自然状态’’说提供了有力佐证，并对未 来更为深入的研究具有指导意义。

关键词：分子动力学模拟，蛋白质一材料表面相互作用，血液相容性，聚氨酯， 亲水改性，接枝率

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As the most direct method of theoretically investigating the behaviors of complex molecular systems，molecular dynamics is very suitable for the simulation of the protein—surface interactions．So we USe molecular dynamics software，Discovery Studio 2．1 for the research．In the Implicit Solvent Model-Generalized Born model， we choose the nine peptides segment of coagulation Factor XII and the fibrinogen

segment as research objects to simulate the interactions between protein(segment)

and surface of polyurethane grafted谢t11 hydrophilic groups．In addition，the system of undisturbed protein(segment)is simulated to represent the natural behavior．By using Discovery Studio(DS)，some parameters which will change during the

interaction between the protein and the surface of the material were calculated．By

comparing the relevant parameters，we can obtain the relationship between the composition,structure of the material and conformation changes of adsorbed protein, verify the rationality of the hypothesis of‘‘Keep Natural Behavior'’，then provide theoretical foundation for designing new anticoagulant polymer materials，selecting

methods during materials preparation process and controlling parameters during

process procedure．

The research provides the det