2020-8-3理论课
亲缘关系和PCA分析
gcta运用的是bed模式
需要转化 make-bed
需要下载gcta,首先需要安装conda而他是基于python的。
无root权限下conda的安装
1,首先通过wget下载miniconda
wget https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-4.7.12-Linux-x86_64.sh --no-check-certificate
2.安装
bash Miniconda3-4.7.12-Linux-x86_64.sh
切换到家目录 cd
source .bashrc
3 修改库源
conda config
cd
vim .condarc
进入文件后修改
ssl_verify: truechannels: - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/r/ - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/pro/show_channel_urls: truechannel_alias: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud
4 创建python子环境
conda create -n xxxx
5 进入python子环境
conda activate xxxx
倘若不行的话,再运行这个命令:conda config --set auto_activate_base false