linux怎么批量移动文件,第一篇简书，简单写一下Linux环境变量和批量移动文件...

这是我的第一篇简书，还不太会Markdown编辑器，先随便写一下子吧，之后慢慢学。2018年11月10号到13号，在珠海跟着健明老师和崔老师学习了近4天的生物信息学，收获颇丰，回来之后也是满腔热血，开始自己的学习，从自己之前用过的TCGA开始。但是TCGA下载的RNAseq文件是一个个独立文件夹，里面都有一个.gz文件，所以第一步，是如何将他们全部转移到同一个目录下，这是我遇到的第一个问题。之前我是用perl脚本解决的，但是看不懂perl脚本的意思，所以还是想用自己可以读的懂的语言去完成。这个心路历程和尝试历程都在下面写了。总之要开始写简书记录自己的成长，同时也是自己的学习笔记，一步一步开始往前走，以后有知识忘记了，也可以回过头来多看看，同时也是和广大生信工作者分享自己的一点经验！

1、`/etc/skel/.bashrc`   #把.bashrc拷过来，根据自己需要修改。如果自己的工作目录下没有的话，有.bashrc文件请忽略这步

2、`cat ~/.bashrc`    #看一下.bashrc里面有什么

3、`cat >> ~/.bashrc`   #添加环境变量，这是cat命令对文本进行内容添加

`PS1="\[\033]2;\h:\u \w\007\033[33;1m\]\u \033[35;1m\t\033[0m \[\033[36;1m\]\w\[\033[0m\]\n\[\e[32;1m\]$ \[\e[0m\]"`  #改变颜色

ctrl + C  #结束命令，按“ctrl + C”，已经修改了环境变量

`source .bashrc`   #每次重新登陆，source一下即可进入环境变量

4、`echo $PATH`   #看一下PATH上有什么

5、`export PATH="$PATH:/home/(...)/"`    #可以修改环境变量里面的路径，使一些软件的目录加入进来，以后source .bashrc之后就可以使用了

6、`vim .bashrc`  #进入vim编辑.bashrc文件

i   #按i键进入编辑模式(INSERT)，然后回车换行，粘贴想要添加的路径或者其他环境变量

Esc , :wq  #按Esc键，然后输入":wq"，即可保存退出

7、总结环境变量，简单说就是相当于建立了自己设置好的一个桌面，桌面上有各种自己想用的快捷方式(和windows系统类比)

***8、`mv /home/vip27/TCGA/RNAseq/*/*.gz /home/vip27/TCGA/RNAseq/merge/`  ##将RNAseq文件夹下面的所有文件夹中的.gz文件，全部转移到RNAseq文件夹下的merge文件夹

##这个是困扰我很久的一个问题，之前使用perl脚本处理的(当然我只是会用，并看不懂perl)，现在用linux完成了自己的第一个shell脚本的书写，感觉很好。因为之前自己写了很多次都没有运行成功，也用了循环，也是失败，现在也不是很清楚为什么，anyway，新技能get！慢慢学习，继续往前走。

9、```perl

use strict;

use warnings;

use File::Copy;

my $newDir="files";

unless(-d $newDir)

{

mkdir $newDir or die $!;

}

my @allFiles=glob("*");

foreach my $subDir(@allFiles)

{

if((-d $subDir) && ($subDir ne $newDir))

{

opendir(SUB,"./$subDir") or die $!;

while(my $file=readdir(SUB))

{

if($file=~/\.gz$/)

{

#`cp ./$subDir/$file ./$newDir`;

copy("$subDir/$file","$newDir") or die "Copy failed: $!";

}

}

close(SUB);

}

}

```

## 最后把可以完成同样任务的perl脚本也粘贴在这里，埋个伏笔，希望以后自己也可以学会perl语言。