python语言零基础-Python语言培训（零基础初级班）

Python是一种解释型、面向对象、动态数据类型的高级程序设计语言。由于Python语言的简洁、易读以及可扩展性，在国内外用Python做科学计算的研究机构日益增多，在生物信息学和医学领域已经有大量程序软件全部或部分使用Python来设计。Python的使用率呈线性增长，已经成为最受欢迎的程序设计语言之一。Python目前拥有很多专用的科学计算扩展库，例如十分经典的科学计算扩展库NumPy、SciPy和生物信息学专用的Biopython，它们分别为Python提供了快速数组处理、数值运算以及绘图功能，还有专门的生物信息学处理分析功能。因此Python语言十分适合工程技术、科研人员处理实验数据、制作图表，甚至开发科学计算应用程序。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言的生物学、医学、农学等人员开展了此培训，帮助大家快速开展生物信息数据各项分析。欢迎您报名参加！

主办单位：北京市计算中心，生物计算事业部

举办地：北京，北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间：2014.6.21-6.24日

培训内容及安排：日期时间授课题目授课内容

第一天09:30-10:30Python概述及其在生物信息领域的应用概括介绍Python语言的概念及特点，及其在生物信息领域的应用

10:30-12:00Python软件安装、运行与基本操作Python及iPython的安装及使用，Python程序的运行；DOS、Unix命令行操作基本命令；Python变量定义、数字及基本运算

13:30-15:00核心数据类型（1）列表、元组

13:30-16:00基本语法结构判断结构、循环结构、异常处理

16:00-17:00实例练习使用python编程，生成斐波那契数字序列

第二天09:30-11:00核心数据类型（2）字符串、字典

11:00-13:00文件与文件夹操作文件的读入与写入、文件夹操作

13:30-17:00实例练习FASTA文件的处理：1、序列基本信息的统计；2、序列反转和切割

第三天09:30-11:00函数和模块系统库函数、第三方函数、自定义函数；模块定义、导入、使用

11:00-12:00正则表达式Python特色功能正则表达式学习与应用

13:30-14:30实例练习系统命令在python中的调用

14:30-17:00实例练习大数据文件的分割及合并

第四天09:30-11:00BioPython简介及应用实例BioPython安装及学习，生物信息学中的实际应用

11:00-12:00BioPython快速应用使用BioPython处理传统的生物信息数据

15:00-17:00实例练习应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。应用biopython在blast xml结果文件中提取目的信息。

授课实例大数据文件分割。

系统命令在python程序中的调用。

fasta文件中序列基本信息统计：序列数、碱基数、及平均长度。

生物信息学二代测序数据质量控制及预处理。（选学）

fasta序列反向互补转换。

应用biopython实现genbank、uniprot格式数据转换为fasta格式。

应用biopython在blast xml结果文件中提取目的信息。

多样品混合测序，根据标签序列barcode对原始测序数据进行分样。（选学）

（此表仅供参考，授课内容以实际授课为准）

【培训特色】

1、对口生物信息；??? 2、非严格语法，适合初学；

3、功能强大、跨平台；4、灵活易用

【报名费用】注册费：3200元/人（含听课费、资料费、上机费、午餐，请自带笔记本电脑以备上机实践使用），主办方可协助安排入住酒店，住宿费用自理。

【付费方式】现金、支票、银行转账、银行汇款

单位全称：北京市计算中心????? 账号：0200151819100023937

开户银行：中国工商银行股份有限公司北京永丰支行

（汇款信息里 备注上："生物计算事业部——您的姓名”）

【报名优惠政策】

1、2014年5月15日前报名，可优惠200元。

2、2人团报每人可减免200元，3人以上团体报名每人可减少400元；

3、4+1团报，可免费赠送一个名额

4、上面3种优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。

5、老学员、老学员介绍的学员均可以再优惠200元。

培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。

【注意事项】

1、已经成功付款的学员，如在开课前7个工作日前联系主办方撤销席位，可退还100%的注册费用；如在开课前3个工作日内（含3个工作日）要求撤销席位则退还80%的注册费用。

2、撤销席位后，学员可提交延期申请，可参加当前时间到2014.12.12日期间由北京市计算中心举办的各类培训，费用将采取多退少补原则。逾期不参加任何培训课程可申请退款，退款期间产生的所有费用由学员本人承担

【联系咨询】

张老师 010-59341771 ,18618295767，QQ号：2814500767，邮箱：zhangly@bcc.ac.cn

员老师 010-59341773, 18701529461 ,? 邮箱：yuanll@bcc.ac.cn

网址：http://bioc.bcc.ac.cn/China/