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原创 Ubuntu16(虚拟机)python工作环境配置
Ubuntu16(虚拟机)python工作环境配置1.安装vmware tools2.换国内源3.安装常用工具4.配置zsh,安装oh-my-zsh5.简单配置6.安装miniconda(python环境)7.安装pycharm8.安装sublime text9.待续1.安装vmware toolscp vmware-tools ~/downloadstar -xf vmware-toolssudo ./install.pl2.换国内源备份源文件sudo cp /etc/apt/source
2020-05-14 15:26:25
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原创 mxnet/gluon的transforms用法
文章目录gluon 提供了mxnet.gluon.data.vision.transforms的module,这里列出来方便查阅1.顺序组合多个变换:transforms.Compose2.转换输入为特定类型:transforms.Cast3.NDArray转成Tensor:transforms.ToTensor4.利用均值和方差归一化:transforms.Normalize5.随机...
2019-12-22 15:50:03
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原创 sublime text3 配置SublimeREPL pdb调试并设置anaconda路径下的python编译
1. 使用package control安装SublimeREPL2. 打开sublime text -----》Preferences------》Browse packages -----》SublimeREPL\config\Python\Main.sublime-menu,修改带有cmd的语句成绝对路径,“cmd”: ["/home/lbc/anaconda3/bin/python", ...
2019-04-02 17:59:21
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原创 Ubuntu sublime text3配置ctrl+鼠标左键进行函数跳转
使用ctrl+鼠标左键代替F12进行函数跳转点击Preferences(首选项)->Browse Packages(浏览插件)进入Packages目录,然后打开User目录,查看User目录里面有没有Default.sublime-mousemap文件,如果没有则创建一个。这个文件是用来配置sublime的鼠标操作的,内容如下:[ { "button": "button2",...
2019-04-02 16:58:05
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转载 Pytorch:transforms的二十二个方法
文章目录一、 裁剪——Crop1.随机裁剪:transforms.RandomCrop2.中心裁剪:transforms.CenterCrop3.随机长宽比裁剪 transforms.RandomResizedCrop4.上下左右中心裁剪:transforms.FiveCrop5.上下左右中心裁剪后翻转: transforms.TenCrop二、翻转和旋转——Flip and Rotation6...
2019-01-07 21:28:16
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原创 计算pytorch标准化(Normalize)所需要数据集的均值和方差
pytorch做标准化利用transforms.Normalize(mean_vals, std_vals),其中常用数据集的均值方差有:if 'coco' in args.dataset: mean_vals = [0.471, 0.448, 0.408] std_vals = [0.234, 0.239, 0.242]elif 'imagenet' in args.da...
2019-01-06 21:36:58
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原创 matlab:将概率图与原始图像叠加生成热图
原始图像和概率图像叠加生成热图:function [map] = cmap()% 原始图像,需要进行灰度化,我这里直接读灰度图im = imread('1-1.png');im = double(im);% 概率图扩展范围是0-255gray = imread('1-2.png');gray = uint8(double(gray) * 255);% jet定义颜色,红-...
2018-12-12 22:21:16
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原创 完整版 ubuntu 16.04LTS 安装tensorflow教程(源码安装)
声明:此方法安装tensorflow亲测有效,即使中间出现问题也都是缺少某个工具、缺少某个文件之类的,都是跟系统有关的小问题!尽量按顺序执行,至少在每一步过程中都按照顺序执行!!安装配置:硬件:GPU:GeForce GTX 1080软件:Ubuntu16.04+Anaconda3-5.1.0+CUDA9.0+CUDNN7.0+tensorflow-r1.7 Tensorflo...
2018-07-13 16:02:33
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原创 ubuntu安装基础入门教程,重启黑屏(踩坑)
安装教程网址:https://jingyan.baidu.com/article/3c48dd348bc005e10be358eb.html按照百度经验里面的流程一步一步做下来,在安装启动引导器设备谨慎选择!如果你只装linux系统,切你只有一块硬盘,那就使用默认选择 /dev/sda作为引导分区如果你时win + linux 双系统,如果想保留win的引导可以先选择你boot分区作为引导,这里是...
2018-07-12 22:55:27
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原创 将本地项目上传github
1. 下载安装git,打开git bash2. cd 到自己工程的路径下使用 ‘git init ’命令,文件夹下会自动添加.git 文件夹3. 建议使用 ‘git add README.md ’添加README.md 文件4. 使用 ‘git add . ’命令将工程所有文件添加到仓库,当然也可添加部分文件,把‘git add filename’5. 可以使用 ‘git status’ 查看添加...
2018-07-10 11:27:41
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原创 Python遍历目录及子目录并将其中的文件复制到指定目录
import os, shutil from tqdm import tqdm # 规范化绝对路径 src_dir = os.path.abspath(r"I:\ADNI_DeepLearning\ADNI1 Annual 2 Yr 3T\MCI") dst_dir = os.path.abspath(r"I:\ADNI_DeepLearning_Copy\MCI") ...
2018-06-13 16:15:17
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原创 医学影像处理相关软件及python包
一、软件1. Freesurfer FreeSurfer是一个软件包,用于分析和可视化来自横断面或纵向研究的结构和功能神经影像数据。FreeSurfer为结构MRI数据提供完整的处理流,包括:颅骨剥离,B1偏置场校正和灰白质分割;重建皮质表面模型(灰白色边界表面和软脑膜表面);标记皮质表面上的区域以及皮层下的大脑结构;用立体定位图非线性配准个体的皮质表面;统计分析组形态测量差异。wi...
2018-06-07 21:36:17
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原创 java实现统计一串序列的概率密度并返回坐标轴数据(用于画概率密度图)
需求:给定一串序列,统计这串序列的概率密度函数步骤:1. 获取序列并从小到大排序,这里使用数组作为参数传入函数 2. 设定区间数量,序列总数/区间数量=区间宽度,每个区间的中点值作为横坐标 3. 求得: 概率= 每个区间内的序列数/序列总数;概率密度= 概率/区间宽度,概率密度作为当前区间的纵坐标 4. 将求得的横纵坐标写在二维数组里(写在ma...
2018-05-17 21:33:05
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转载 转:常见的医学影像数据格式(2)
常见的医学影像数据格式(2)1. 医学影像学医学影像学Medical Imaging,是研究借助于某种介质(如X射线、电磁场、超声波等)与人体相互作用,把人体内部组织器官结构、密度以影像方式表现出来,供诊断医师根据影像提供的信息进行判断,从而对人体健康状况进行评价的一门科学,包括医学成像系统和医学图像处理两方面相对独立的研究方向。仪器主要包括X光成像仪器、CT(普通CT、螺旋CT)、正子扫描(PE...
2018-05-14 17:32:53
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转载 转:常见的医学影像数据格式(1)
常见的医学影像数据格式 在fMRI的早期,由于大多数据都用不同研究脉冲序列采集,然后离线大量重建,而且各研究中心文件格式各不相同、大多数的分析软件也都是各研究单位内部编写运用。如果这些数据不同其他中心交流,数据的格式不影响他们的使用。因此图像格式就像巴别塔似的多式多样。随着fMRI领域的不断发展,几种标准的文件格式逐渐得到了应用,数据分析软件包的使用促进了这些文件格式在不同研究中心和实验室的广泛运...
2018-05-14 17:20:30
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原创 安装tensorflow出现的问题解决:import tensorflow as tf 时报错
使用Anaconda 安装python和tensorflow 环境,安装完成后 测试import tensorflow as tf 报如下错误:出错原因:直接安装python环境时,可以选择下载一个vs2015库和运行时组件,使用Anaconda安装没有默认下载安装,如果没有这个库就会报上述错误解决方案:1)直接下载vs20152)下载这个环境 Visual C++ Redistributable...
2018-05-09 16:51:06
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原创 MyEclipse整合SSM框架(四):整合前端页面,通过ajax请求获得数据
Spring+SpringMVC+Mybatis 框架已经搭建完成,其中包括:(1)maven工程的搭建 (2)框架所需要的配置文件的配置 (3)Mybatis 建立逆向工程链接数据库。相应的配置文件参见前几篇博客。此篇整理前端页面发送ajax 请求到后端,后端通过 Mybatis 链接数据库,返回JSON数据给前端页面,完成显示功能。一、在webapp目录下建立 index.jsp ,将前端内容...
2018-05-04 15:27:03
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原创 mybatis的映射文件给sql语句传入String类型等单一参数
在项目中需要统计表中某一列有多少数据,使用sql 语句如下:select count(p_real_frame1) from tbl_frame 其中,想把 count( parameter ) 括号中的参数用占位符表示,通过参数传递完成这个sql语句,这样就可以写成通用的查询某一列有多少数据。要拼接这个 sql 语句,括号里的内容设置为 String 类型的,即整个 sql 语句作为一个字符串...
2018-05-04 14:29:58
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原创 将matlab中的多列数据保存到mysql数据库
因为需要将算法模型嵌入到网站中显示,在matlab中做仿真得到了一些数据,需要保存在我的后台数据库中,数据库用的是mysql,经过几番尝试,最终较为不麻烦的将数据导入到mysql中。第一次尝试:如上图所示,我想保存的数据是两列不同的帧大小,但是行数不同。如果将两列数据直接复制到一个上,会产生行数少相差行数多的行补零的情况。这样导出的数据集还要把零处理掉,比较麻烦。 ...
2018-04-26 22:28:09
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原创 ADNI数据集相关概念初步整理
最近准备开始研究ADNI(Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative)数据集,刚在网站上注册和提交了申请(审核通过了才能下载数据集),审核时间大概是一周。在此期间,将数据集涉及的相关概念以及Alzheimer's Disease相关知识点做一些粗略整理。 在患者生前作出AD诊断,目前认为患者不但要具有进行性痴呆的临床表现,并且还要有AD的神...
2018-04-20 20:51:22
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原创 MyEclipse整合SSM框架(三):详解Mybatis逆向工程配置一对一关联表,查询结果排序问题
先说问题:在搭建SSM(Spring+SpringMVC+Mybatis)框架,从后台数据库查询出数据提供给前端页面进行分页显示时候,发现分页查询出来的结果在前端页面上显示并不是按照主键 id 排序的,而是先按照关联表id,也就是主表外键的 id 分成不同的部门(我这里是employee 和 department) ,每个部门中再按照 id 顺序显示记录。这样导致主键 id 为 2的反而跑到了查询...
2018-04-13 13:15:13
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原创 MyEclipse整合SSM框架(二):Mybatis逆向工程配置以及dao层增删改查测试
说明:项目工程采用 maven 管理,maven 工程的建立参见: https://blog.csdn.net/weixin_38533896/article/details/7976818 Spring + SpringMVC+ Mybatis 相关 .xml 文件配置参见: https://blog.csdn.net/weixin_...
2018-04-09 15:41:33
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原创 MyEclipse整合SSM框架(一):相关xml文件的配置(Spring+SpringMVC+Mybatis)
说明:项目工程采用maven管理,各类组件版本及maven工程的建立具体参见: https://blog.csdn.net/weixin_38533896/article/details/7976818 本篇博客是接续上一篇博客完成的1. 配置 pom.xml 文件,引入相关jar包<project xmlns="http://maven.apache.org/POM/4.0...
2018-04-09 15:04:34
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原创 myeclipse2015配置和建立maven工程(及出现问题解决方案)
说明:myeclipse2015自带maven插件,在使用自带maven建立工程时候,发现maven的配置文件setting.xml路径找不到,没法设置user setting.xml。索性自己安装了一个maven-3.5.3版本,安装和配置过程如下。1. 下载maven插件https://maven.apache.org/download.cgi2.myeclipse中选择你下载并解压好的mav...
2018-03-31 13:56:58
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1
尚硅谷_佟刚_Spring源码及PPT
2018-02-27
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