python读什么类型文件最快的软件_.dcm格式文件软件读取及python处理详解

要处理一些.DCM格式的焊接缺陷图像，需要读取和显示.dcm格式的图像。通过搜集资料收集到一些医学影像，并通过pydicom模块查看.dcm格式文件。

若要查看dcm格式文件，可下Echo viewer 进行查看。

若用过pycharm进行处理，可选用如下的代码：

# -*-coding:utf-8-*-

import cv2

import numpy

import dicom

from matplotlib import pyplot as plt

dcm = dicom.read_file("dcm")

dcm.image = dcm.pixel_array * dcm.RescaleSlope + dcm.RescaleIntercept

slices = []

slices.append(dcm)

img = slices[int(len(slices) / 2)].image.copy()

ret,img = cv2.threshold(img,90,3071,cv2.THRESH_BINARY)

img = numpy.uint8(img)

im2,contours,_ = cv2.findContours(img,cv2.RETR_LIST,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)

mask = numpy.zeros(img.shape,numpy.uint8)

for contour in contours:

cv2.fillPoly(mask,[contour],255)

img[(mask > 0)] = 255

kernel = cv2.getStructuringElement(cv2.MORPH_ELLIPSE,(2,2))

img = cv2.morphologyEx(img,cv2.MORPH_OPEN,kernel)

img2 = slices[int(len(slices) / 2)].image.copy()

img2[(img == 0)] = -2000

plt.figure(figsize=(12,12))

plt.subplot(131)

plt.imshow(slices[int(len(slices) / 2)].image,'gray')

plt.title('Original')

plt.subplot(132)

plt.imshow(img,'gray')

plt.title('Mask')

plt.subplot(133)

plt.imshow(img2,'gray')

plt.title('Result')

plt.show()

也可用如下代码：

import pydicom

import os

import numpy

from matplotlib import pyplot,cm

# 用lstFilesDCM作为存放DICOM files的列表

PathDicom = "dicom/2" #与python文件同一个目录下的文件夹

lstFilesDCM = []

for dirName,subdirList,fileList in os.walk(PathDicom):

for filename in fileList:

if ".dcm" in filename.lower(): #判断文件是否为dicom文件

print(filename)

lstFilesDCM.append(os.path.join(dirName,filename)) # 加入到列表中

## 将第一张图片作为参考图

RefDs = pydicom.read_file(lstFilesDCM[0]) #读取第一张dicom图片

# 建立三维数组

ConstPixelDims = (int(RefDs.Rows),int(RefDs.Columns),len(lstFilesDCM)) # 得到spacing值 (mm为单位)

ConstPixelSpacing = (float(RefDs.PixelSpacing[0]),float(RefDs.PixelSpacing[1]),float(RefDs.SliceThickness))

# 三维数据

x = numpy.arange(0.0,(ConstPixelDims[0]+1)*ConstPixelSpacing[0],ConstPixelSpacing[0]) # 0到（第一个维数加一*像素间的间隔），步长为constpixelSpacing

y = numpy.arange(0.0,(ConstPixelDims[1]+1)*ConstPixelSpacing[1],ConstPixelSpacing[1]) #

z = numpy.arange(0.0,(ConstPixelDims[2]+1)*ConstPixelSpacing[2],ConstPixelSpacing[2]) #

ArrayDicom = numpy.zeros(ConstPixelDims,dtype=RefDs.pixel_array.dtype)

for filenameDCM in lstFilesDCM:

ds = pydicom.read_file(filenameDCM)

ArrayDicom[:,:,lstFilesDCM.index(filenameDCM)] = ds.pixel_array # 轴状面显示

pyplot.figure(dpi=300)

pyplot.axes().set_aspect('equal','datalim')

pyplot.set_cmap(pyplot.gray())

pyplot.pcolormesh(x,y,numpy.flipud(ArrayDicom[:,2])) # 第三个维度表示现在展示的是第几层

pyplot.show()

这两个代码都是可以进行读取的。但是不知道为什么在焊接检测中的dcm图像却无法进行读取。

以上这篇.dcm格式文件软件读取及python处理详解就是小编分享给大家的全部内容了，希望能给大家一个参考，也希望大家多多支持我们。