基于python的数据分析外文文献_python外文文献

本文介绍了Environment for Tree Exploration (ETE)——一个Python编程工具包,用于自动化处理、分析和可视化层级树。ETE提供广泛的树处理选项,支持对进化树和聚类树进行特定分析,特别适合大规模分析。该工具允许独立分析树分区,支持扩展Newick格式,集成了节点注释系统,并可以将树与多重序列比对或数值数组等外部数据链接。ETE还内置了包括基于进化的同源性预测和聚类验证工具在内的分析方法,以及可编程的树绘制引擎,用于定制节点特定的可视化。ETE是一个全面的树数据结构操作工具,扩展了其他更通用生物信息学工具包的功能,适用于大规模数据处理。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

.

.

a python Environment for Tree Exploration

Reviewed

by

Jaime

Huerta-Cepas,corresponding

author1

Joaqu

í

n

Dopazo,2

and

Toni

Gabald

ó

ncorresponding author1

Abstract

Many bioinformatics analyses, ranging from gene clustering to phylogenetics,

produce hierarchical trees as their main result. These are used to represent the

relationships

among

different

biological

entities,

thus

facilitating

their

analysis

and

interpretation.

A

number

of

standalone

programs

are

available

that

focus

on

tree

visualization

or

that

perform

specific

analyses

on

them.

However,

such

applications

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