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尽管神和人在认识世界的过程中不可避免的要受到自己的本身天赋的影响和局限,但这并未阻挡神与人们对世界本源的探索。而且,剧中也尽量对人们探索宇宙深层次元理的方式进行了一定的展示和描述。比如,银河之力的虚拟引擎雄芯和乾坤计算机、鹤曦王的宇宙计算机、天使彦的天刃七号、死神卡尔的大时钟【恒星计算机】,他们是透过世界万物的表象,来对现实世界底层运营规律进行元理层面的把握,了解这个世界的元知识、元理学,即所谓大道至简。哲学任务就是对现实世界进行元理层面的把握,把多综合为一或把一区分为多,一和多都是元理。
无论是天使、恶魔、冥河、烈阳、德诺,他们都并未创造元理,而是在发现元理,并对宇宙的元理进行清晰表达、系统构造,这样的元理系统才适用于各种神的文明进行阐释世界或指导实践。【所以,超神学院在很大程度上是一部非常唯物的作品】。
但这种阐述会因为物种的不同而有不同的理解,比如神河体的众文明是一种理解和构造的方式,而三角体则是采用另一种方式对世界和宇宙的元理进行构造和理解。而这一点,实际上在三角体与葛小伦和炙心的两次交涉中有所体现。这就好比,对于一维生物来说,他的感知为一线,所以线上的一个点就可以阻止他前进,而二维生物感知平面,但是平面的一个区域可以将其活动框住,但是三维生物可以以高度跨越过去。但是对于三维生物【人、哺乳动物】能够感知三维空间,只有封闭的空间才能将其限住。但是四维生物却可以通过第四维度跨越过去。
既然神河、三角、兽体都具有局限性,那么怎样才能够弄清世界的本源呢?
卡尔运用打开空间获取虚空微粒的方式,来寻找次生物面【实际上,超神学院的观点很有可能是,宇宙是一台超级运算的计算机,而次生物则是计算机之外的生物,而剧中所谓的主生物界则是计算机内的由程序构建的各种信息的集合体,那么处于这个超级计算机内的主生物能否感知外面的世界呢?当然,这里可能还有另一个理论,就是泡理论,即每个宇宙都是一个巨大的泡】。
于是这里就会涉及到可知论和不可知论的问题。
可知论就是认为世界是可以被认知的,认为人可以凭借感觉器官及其延伸(科学仪器)完全认知世界,而至今尚未被认知的部分只是由于技术的不发达,人完全认识世界是必然。而不可知论则是认为世界是不能被认知的或不能被完全认知,此处的不能完全被认知并非“尚未被认知”,而是指世界的某些部分或某些层面,人类是永远无法知道其真相的。“概念世界”是研究不可知论时不可不提的概念。也就是说身处于这个系统中的认识主体会受限于自身的局限,不可能探知宇宙的本源。
不过,从本剧中来看,似乎是一种二元论:认为世界的本源是意识和物质两个实体,试图调和唯物和唯心的哲学观点。意识是一种信息,物质也是一种信息,只要信息充足,且在合适的条件下就会进行信息对物质和意识的构建。而且本剧甚至还有一定的知识论的倾向。事实上,这也是一种由认识论向语言论的深层次递进,当然还有一定的解构主义成分。