python随机森林筛选变量_讨论记录｜用随机森林对生存数据降维，筛选signature

昨晚，小伙伴收到了大鱼海棠为我们带来的FigureYa182RFSurv，使用随机森林对生存数据降维，根据变量重要性排序并筛选基因组成prognostic signature。

这是我们第二次众筹随机森林相关分析，上次的FigureYa159LR_RF，是在LASSO降维的基础上，采用logistic regression或Random forest的方法，进行5-fold cross-validation评估LASSO selected feature的预测效能。

大鱼海棠为我们带来了众多或经典或酷炫的好用代码，具有丰富的医学统计分析经验。这次建立FigureYa182RFSurv专属讨论群，请大鱼海棠入群答疑。小伙伴就相关问题展开讨论，小丫整理记录下来，留下这宝贵资源。

HSZ：请问这个安装是哪里出问题了，我百度也不知道怎么解决？

大鱼海棠：https://share.weiyun.com/0Qk7bvR6，直接把这个拖到R的library下解压试试，我以前这样做似乎也可以用，在windows里。

ZJH问：老师，您好！imp.cutoff这个重要性阈值的怎么选择？

大鱼海棠：没有固定cutoff。结果导向的，嫌结果太多就设高一点

LGM问：海棠哥好，请教一下筛选出来的特征要组合成预后signature，是还需要进一步使用多因素COX回归来求变量的系数吗？

大鱼海棠：嗯我会建议这样做，但是多因素这部不进行变量筛选了。

Allittis问：海棠老师的意思是直接多因素全部纳入算一个系数即可，是不&#