本文介绍了GEPIA2数据库在生信分析中的应用，涉及数据来源、工作流程，包括基因一般性分析、差异分析、表达DIY、生存分析、Isoform分析、基因相关性分析和PCA降维等，并提供了肝癌分析实例。
所谓工欲善其事，必先利其器，从今天开始，我们来介绍TCGA数据库的使用。今天我们来介绍一款非常容易上手的数据库：GEPIA2 链接点这里 话不多说，直接进入正题
GEP1A2数据来源
如图所示，GEPIA2数据来源于TCGA和GTEx数据库。TCGA我们已经介绍过，不过GEPIA2对TCGA数据经过了筛选，具体筛选标准并没有详细介绍。比如肝癌TCGA有372例肿瘤组织，这里只有369例。
下面简单介绍一下GTEx
GTEx
GTEx（Genotype-Tissue Expression）
该项目研究来自449名生前健康的人类捐献者的7000多份尸检样本，涵盖44个组织（42种不同的组织类型），包括31个实体器官组织、10个脑分区、2个来自捐献者血液和皮肤的细胞系。GTEx可以有效弥补TCGA正常组织不多的缺点。
GEP1A2工作流程
下面我们来熟悉这个数据库的使用
基因一般性分析
我们以LDHA为例可以检索到LDHA的基因信息
LDHA的泛癌表达情况
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