java 计算lcs,GitHub - boycy815/java-diff: 根据LCS最长公共子串算法，采用java实现比较文本的不同之处(增加，删除，更新)...

原理

举例说明：A=GGATCGA，B=GAATTCAGTTA

第一步：初始化LD矩阵

公式一

若ai=bj，则LD(i,j)=LD(i-1,j-1)

若ai≠bj，则LD(i,j)=Min(LD(i-1,j-1),LD(i-1,j),LD(i,j-1))+1

第二步：利用上述的公式一，计算第一行

第三步，利用上述的公示一，计算其余各行

第四步，定位在矩阵的右下角

第五步，回溯单元格，至矩阵的左上角

若ai=bj，则回溯到左上角单元格

若ai≠bj，回溯到左上角、上边、左边中值最小的单元格，若有相同最小值的单元格，优先级按照左上角、上边、左边的顺序

若当前单元格是在矩阵的第一行，则回溯至左边的单元格

若当前单元格是在矩阵的第一列，则回溯至上边的单元格

依照上面的回溯法则，回溯到矩阵的左上角

第六步，根据回溯路径，写出匹配字串

若回溯到左上角单元格，将ai添加到匹配字串A，将bj添加到匹配字串B

若回溯到上边单元格，将ai添加到匹配字串A，将_添加到匹配字串B

若回溯到左边单元格，将_添加到匹配字串A，将bj添加到匹配字串B

搜索晚整个匹配路径，匹配字串也就完成了

A：GGA_TC_G__A

B：GAATTCAGTTA

成果物