生信所需计算机水平:
基本的Linux操作命令 awk/sed/grep 编写基本的bash script
精通Python 掌握Python到面向对象,能写Class、Python包、C拓展
数据处理,数据分析,写分析流程,统计分析,机器学习,可视化。
常用指令
初窥Linux 之我最常用的20条命令总结www.jb51.net1、cd命令 切换目录
这是一个非常基本,也是大家经常需要使用的命令,它用于切换当前目录,它的参数是要切换到的目录的路径,可以是绝对路径,也可以是相对路径。如:
![ddf2d928b42a89cea277d92f32e3c973.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/eacd58715e1224ae218f614a006f9892.png)
2、ls命令 显示文件或目录
这是一个非常有用的查看文件与目录的命令,list之意,它的参数非常多,下面就列出一些我常用的参数吧,如下:
![bdae0cddc4bf61177fb3cc9e285338e3.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/95edcda91033be8328785004f8261933.jpeg)
![fc0be4efd5603e34f86db72e341752da.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/bfccceae1b848c6433f9423cd9ced6cc.jpeg)
![d6cb8068bd036eae3183184c3d9a1afc.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/f225807669c88c953a4fac349b4b55ac.jpeg)
3、awk、sed、find、grep命令
Linux学习—四剑客awk、sed、find、grep实战讲解_哔哩哔哩 (゜-゜)つロ 干杯~-bilibiliwww.bilibili.com![eba7e9af72fe843f8fb01c16dd651d89.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/39a9f1619e7bffb160afce1684e71b19.png)
![241d7f369486389210fac6582f69037f.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/7b804a43619bc38337ffa8a6700e32b1.jpeg)
(powershell里边的find指令和linux指令含义不同!后期学习!)
(1)find 命令查找某些文件或者目录
Linux find 用法示例 - wanqi - 博客园www.cnblogs.com#find比较齐全的指令方法
find /home/ -name “test.txt” #可以在home文件夹下找到所有的test.txt文件
![493f4407ecd0642cb97fb414fc23ab4e.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/4d3bd12224d67d6e80d7c4ca555a768c.jpeg)
![47a60eb78c10c1c597bf2da26051651d.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/add4dde366b6f2418e3ffb64ca4df71d.png)
*代表通配符。 找到home/test/upload/文件夹下所有的.txt文件
![c6c6f31b7f51e94c1a19e990f7da0cd7.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/aa75a1eb7d84d91d19888eb64809094e.jpeg)
显示文件的类型(是文件还是文件夹)
显示30天以前的文件
显示1天以内的文件
找到符合条件的文件并删除
删除之后想重新创建
![f0a064eec96585089819b0f3d19f60a5.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/361c6fa4a4c167ad234679f74c630470.png)
拷贝“*.txt”这个文件或者目录到tmp这个文件夹中
![bf6bfd7a8fe7cbac5e53f3adff80e5c3.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/46f1b97b35422fcece0da4e9d57d68d9.png)
找大于10k的文件
![51d395df434c4ebbfec467b6b3360451.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/24b3847cc2925c5fb03baed2eab404c6.png)
找大于5M的文件
![f7b7d2d056cc84fd377a0e28c96f226b.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/99fc5db0284b9342f535d99cbbef337f.jpeg)
![218d872fdc7c0c9145687863371ba5e5.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/fe51fd8375ad247a40fc4aa35f964bac.jpeg)
![baae2a7551258e4d0b1ece82ab6d944f.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/be4ec598c7e66c3414e4a8c755684259.jpeg)
找到文件并删除
grep
该命令常用于分析一行的信息,若当中有我们所需要的信息,就将该行显示出来,该命令通常与管道命令一起使用,用于对一些命令的输出进行筛选加工等等,它的简单语法为
grep [-acinv] [--color=auto] '查找字符串' filename
它的常用参数如下:
![87fffc1dd9fdb93645beedf22e4bbe65.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/f68bba73e122676d9852db7acf68ae98.jpeg)
![5d80035d7a77b8545ec63c68156ecbe7.png](https://i-blog.csdnimg.cn/blog_migrate/040c345ad9348d4597eac55fee272195.jpeg)