python用pandas读取数据时出现错误_Python Pandas错误标记数据

lotrus28..

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尝试读取带有空格,逗号和引号的制表符分隔表时,我遇到了类似的问题:

1115794 4218 "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Bacillales", "f__Bacillaceae", ""

1144102 3180 "k__Bacteria", "p__Firmicutes", "c__Bacilli", "o__Bacillales", "f__Bacillaceae", "g__Bacillus", ""

368444 2328 "k__Bacteria", "p__Bacteroidetes", "c__Bacteroidia", "o__Bacteroidales", "f__Bacteroidaceae", "g__Bacteroides", ""

import pandas as pd

# Same error for read_table

counts = pd.read_csv(path_counts, sep='\t', index_col=2, header=None, engine = 'c')

pandas.io.common.CParserError: Error tokenizing data. C error: out of memory

这说明它与C解析引擎(默认引擎)有关。也许更改为python会改变一切

counts = pd.read_table(path_counts, sep=&#

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