linux读取一行数据命令,常用的linux命令和逐行数据处理的例子

原标题：常用的linux命令和逐行数据处理的例子

Linux具有开源，处理性强等优点。

并且由于生物数据量较大，对数据处理性能要求更高，

所以生物信息分析软件大多都是针对linux系统进行开发的。

在日常的生物信息分析中，

我们几乎离不开linux平台，

今天我们给您介绍的小命令你可能常常使用，

能够帮助我们简单舒适的处理手头上庞大的生物信息数据。

一，常用的小命令

cd打开文件目录

ls显示文件

ls -al |grep '^d' 显示目录ls -al |grep '^[^d]' 在一个目录中查询不包含目录的所有文件

less文件名 查看文件内容 按“q” 退出

cat文件名 打开文件，可以多次打开几个文件

cat > 2.txt (用定向符创建文件,填写内容后,按ctrl+d保存内容)

grep-参数 文件名

-i 不区分大小写

-v 显示不符合条件的所有行

-c 显示符合条件的所有行数(符合条件的数量)

mkdirmywork 建立mywork这个目录

cpfilename1 filename2 拷贝文件或目录

mv源文件或目录 目标文件或目录 移动或重命名文件cut-f ‘1,5’文件 剪切文件的第1列和第5列

head-2 文件名 显示2行

head -100 文件名 | tail -10 >>a.log 提取文件第91-100行数据

wc-参数 文件名 统计文本大小，字符多少，行数

-c 统计文本字节数

-m 统计文本