python能处理jpg图像文件_一种基于python实现医学图像文件连续转换成jpg映像文件的方法与流程...

本发明涉及python应用与开发技术领域，具体涉及一种基于python实现医学图像文件连续转换成jpg映像文件的方法。

背景技术：

随着医疗科技的发展，dicom被广泛应用于放射医疗、心血管成像以及放射诊疗诊断设备上，并且在眼科和牙科等其它医学领域得到越来越深入广泛的应用。在数以万计的在用医学成像设备中，dicom是部署最为广泛的医疗信息标准之一。当前大约有百亿级符合dicom标准的医学图像用于临床使用。但对于病患及医学系学生来说，dicom格式的图像文件需要特定的程序才能打开，在各种生活情景中造成了各种不便。

本发明结合python编程技术开创了一种简单快捷，成熟的图像转换方法，针对目前越来越广泛使用的医学图像文件，解决了其需要特定程序才能打开的不便，并且提供了连续转换的便利功能，达到提高医学图像文件易使用性，易转换性的作用。

技术实现要素：

本发明结合python编程技术开创了一种简单快捷，成熟的图像转换方法，针对目前越来越广泛使用的医学图像文件，解决了其需要特定程序才能打开的不便，并且提供了连续转换的便利功能，达到提高医学图像文件易使用性，易转换性的作用。

本发明解决上述技术问题的技术方案是：

所述的方法包含以下几个步骤：

步骤一：根据程序运行需求，导入所需的模块；

步骤二：环境的初始化，包括变量，路径等；

步骤三：图像转换核心代码的撰写；

步骤四：图像转换关键方法的撰写；

步骤五：转换成功的图像的路径拼接及显示。

所述的步骤一中，根据程序运行需求，导入所需模块的具体步骤如下:

(1)导入基于itk内核的python封装层：simpleitk模块；

(2)导入支持高级大量的维度数组与矩阵运算的模块：numericalpython(numpy)模块；

(3)导入用以链接opencv的模块：cv2模块；

(4)导入用以实现与具体平台无关的操作系统功能的os模块；

(5)导入图像处理模块：image模块；

(6)导入时间模块：time模块。

所述的步骤二中，环境的初始化的具体步骤如下:

(1)设置计数器counter，令它为1；

(2)设置要转换的医学图像文件的路径，比如：path="/users/test"；

(3)使用os.listdir()方法，将括号中路径下包含的文件或文件夹的名字的列表返回给filename，比如：filename=os.listdir(path)；

(4)输出filename的内容到屏幕上，给用户确认列表中的文件是否就是要转换的全部医学图像文件。

所述的步骤三中，图像转换核心代码的撰写的具体步骤如下：

(1)用一条判断语句实现代码的合理调用：if__name__=='__main__'；

实现了当该模块被直接运行时，才允许运行之后的语句；

(2)写一个for()循环，并且读取dicom文件的相关信息；

(3)获取dicom文件的array：用simpleitk读取图像数据的坐标顺序zyx，具体的数据格式类似于(1，height，width)的形式，比如：img_array=sitk.getarrayfromimage(ds_array)；

(4)设置中间变量temp，将图像的array信息赋给temp；

(5)获取array中的height和width，并将其中最大的值赋给中间变量high，其中最小的值赋给中间变量low；

(6)调用图像转换的关键方法，比如：transform_to_jpg(img_array,low,high,output_path)；

(7)实现了图像的转换，输出提示信息'finished'。

所述的步骤四中，图像转换关键方法的撰写的具体步骤如下：

(1)调用np.array()方法，构建一个图像数据信息的数组；

(2)对数组中的每一个数据进行处理变换，方法为：transform=(img-array[0])/(array[1]-array[0])；

(3)将像素值范围设置为[0,255]，且数据类型转换成astype；

(4)调用cv2模块的imwrite()方法，四个输入参数分别为：图像的array信息，中间变量high，low的值，转换的输出路径。

所述的步骤五中，转换成功的图像的路径拼接及显示的具体步骤如下：

(1)设置输出文件夹的路径，比如：outputpath="/users/output/"；

(2)设置每一个转换成功的jpg文件的文件名，第一个为1，下一个累加一，为二，以此类推；

(3)在文件名之后加上jpg文件的后缀名，比如fullname=firstname+'.jpg'；

(4)将jpg文件的文件名及文件夹路径合并在一起输出到屏幕上。

本发明结合python编程技术开创了一种简单快捷，成熟的图像转换方法，针对目前越来越广泛使用的医学图像文件，解决了其需要特定程序才能打开的不便，并且提供了连续转换的便利功能，达到提高医学图像文件易使用性，易转换性的作用。

附图说明

下面结合附图对本发明进一步说明：

图1是本发明方法流程图。

具体实施方式

如图1所示，本发明具体包含以下几个步骤：

步骤一：根据程序运行需求，导入各种所需的模块：simpleitk模块，numpy模块，cv2模块，os模块，time模块，image模块；

步骤二：环境的初始化，包括：计数器变量的初始化，待转换文件路径的设置，待转换文件列表的读取，待转换文件列表的输出；

步骤三：用一条判断语句实现代码的合理调用：if__name__=='__main__'；

实现了当该模块被直接运行时，才允许运行之后的语句；

步骤四：写一个for()循环，并且读取dicom文件的相关信息；

步骤五：获取dicom文件的array：用simpleitk读取图像数据的坐标顺序zyx，具体的数据格式类似于(1，height，width)的形式，比如：img_array=sitk.getarrayfromimage(ds_array)；

步骤六：设置中间变量temp，将图像的array信息赋给temp；

步骤七：获取array中的height和width，并将其中最大的值赋给中间变量high，其中最小的值赋给中间变量low；

步骤八：调用图像转换的关键方法，比如：transform_to_jpg(img_array,low,high,output_path)；

步骤九：实现了图像的转换，输出提示信息'finished'；

步骤十：调用np.array()方法，构建一个图像数据信息的数组；

步骤十一：对数组中的每一个数据进行处理变换，方法为：transform=(img-array[0])/(array[1]-array[0])；

步骤十二：将像素值范围设置为[0,255]，且数据类型转换成astype；

步骤十三：调用cv2模块的imwrite()方法，四个输入参数分别为：图像的array信息，中间变量high，low的值，转换的输出路径；

步骤十四：先设置输出文件夹的路径，比如：outputpath="/users/output/"；

步骤十五：设置每一个转换成功的jpg文件的文件名，第一个为1，下一个累加一，为二，以此类推；

步骤十六：在文件名之后加上jpg文件的后缀名，比如fullname=firstname+'.jpg'；

步骤十七：将jpg文件的文件名及文件夹路径合并在一起输出到屏幕上。