本文作者蒋刘一琦,自嘲是一个有艺术追求的生信狗,毕业于浙江大学生物信息学专业,目前在复旦大学就读研究生,研究方向为宏基因组。
在生物领域我们常常使用R语言对数据可视化。在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的图突出该信息。本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法,希望能够帮助到各位读者。
什么是箱形图
箱形图(Box-plot)是一种用作显示一组数据分散情况的统计图,因形状如箱子而得名。除了生信领域,该图在其他领域也经常被使用。主要用于反映原始数据分布的特征,并且可以进行多组数据分布特征的比较。箱形图能显示出一组数据的最大值(Maximum)、最小值(Minimum)、中位数(Median)及上下四分位数(1st/3rd Quartile),同时还可以显示逸出值(Outlier)。
那么,这些值是如何被计算出来的呢?什么样的数据会被判定为逸出值呢?
第一四分位数(Q1)