的单侧t检验_R语言执行两组间差异分析T检验

最新推荐文章于 2024-08-14 01:00:00 发布

weixin_39754398

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文章标签：的单侧t检验

本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_39754398/article/details/111708779

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本文介绍了如何在R中进行单侧t检验，以分析两组间的差异。通过数据预处理、正态性检验，然后进行独立样本和非独立样本的t检验，展示了如何判断不同分组间的alpha多样性指数是否存在显著差异，并提供相关R代码示例。

摘要由CSDN通过智能技术生成

两组间差异分析之T检验在R中实现

做统计学分析的其中一个重要目的就是寻找组间差异，在研究中，我们最常关注的问题莫过于处理组与对照组是否存在了显著不同。就两组间比较而言，t检验是常见的分析方法之一。

本文简介怎样在R中进行t检验，以实现两组间差异分析。

本文使用的作图数据的网盘链接(提取码 6268)：

https://pan.baidu.com/s/108oBkDTkuJ1HGBPX0h5Osg

文件“alpha.txt”为某16S细菌群落测序所获得的部分alpha多样性指数数据，包含3列信息：sample，样本名称；observed_species和shannon分别为两种类型的alpha多样性指数。文件“group.txt”为各样本分组信息，第一列(sample)为各样本名称；第二列(group)为各样本的分组信息。

接下来，我们期望在R中运行t检验，以查看不同分组间(两两分组之间)的各alpha多样性指数是否存在显著不同。

数据预处理及正态性假设检验

数据预处理

首先将上述两个数据表读入 R 中，并合并在一起。

library(reshape2)
#读入文件，合并分组信息，数据重排
alpha group  alpha  
#我们期望查看 group1 和 group2 的 observed_species 指数是否存在显著差异
#选择要比较的分组
richness_12 richness_12$group head(richness_1