进行任何类型的写作，我们都希望达到一种行云流水般的感觉，但是前提是需要我们有灵感。这或许是任何写作的首要因素。然而当灵感迟迟不愿意进入我们的头脑时，随手写一写可能是迎接它的一种好办法。当你使用Microsoft Word时，可能每写几句，就会习惯性的点点鼠标，寻找和释放一下Word的功能。或许你只是希望你的文字变得更“漂亮”一些，或许只是在寻找灵感的间隙动弹一下手指。不管怎样，Word都会听话地照做，让你脑中所有设计好的一切都立即呈现在你面前，这就是Word所见即所得的魅力。
使用LaTeX写作，所有的一切都变得不同了。它不需要你写几句就点点鼠标，也不需要你去即时处理那些“看得见的漂亮”，它只会让你专注于写作。本文并不处理LaTeX和Word的种种感情纠葛。本文的目的，就是让你感受到使用LaTeX时那种行云流水般的感觉。而且，更重要的是，让所有需要处理化学结构的同行，了解需要处理众多附带编号的结构式时的另一种选择。
准备工作：
- 下载并安装LaTeX。
- 选用一种自己喜欢的编辑器。笔者使用的是兼容Mac和iOS系统Texpad，如不需云端，一次付费24.99 EUR，终身使用。
- 使用TeX Live Utility安装必要的软件包。此文涉及的功能需安装chemstyle，auto-pst-pdf等。
刚打开编辑器时当然是一片空白，现在我们就逐步在里面补充上一些东西，让它做好后续持续性写作的准备。
为了让LaTeX更加懂我们的写作，我们需要设置几项参数：
documentclass[a4paper]{article} %此处设置页面大小及文档类型
usepackage[T1]{fontenc} %此处设置字体
usepackage{graphicx, auto-pst-pdf} %此处使.eps文件可转化成.pdf并应用自动编号功能
usepackage[journal=angew]{chemstyle} %此处设置图式的样式以上四行的参数设置可以保证我们执行整个文档的格式统一性，其他的格式可以根据自己的喜好进行设置。此时，如果你在下一行键入“Hello Chemistry!”并执行排版，你并不会看到在生成的PDF的窗口显示出“Hello Chemistry!”字样，这是因为我们还并没有告诉LaTeX我们要正式开始文档的写作了。为了执行这项“通知”，我们需要键入以下命令：
begin{document} %告诉LaTeX此处开始便是文档内容了
Hello Chemistry! %同Hello World一样或许能带我们好运：）
end{document} %告诉LaTeX此处是文档的结尾如上操作之后，点击“排版”按钮，我们便可以看到当前的效果了。
至此我们已经可以在一个设置好格式的文档中键入文字了，也可以开始行云流水般的写作体验了（如果你只是写纯文字的小说）。对于专业的化学文档来说还远远不够，我们接下来就需要来插入一些图式（Scheme）来说明如何对结构式进行自动编号。我们以一个经典的人名反应为例来进行说明。自动编号的核心步骤如下：
- 使用ChemDraw绘制结构式或反应式，并在对应结构式下方标注“标记代码”。该“标记代码”无固定格式要求，但是为了方便区分，可自定义一些格式，例如：反应条件箭头左方为反应物，可使用SM1, SM2, SM3...进行标记；同理，箭头右侧为生成物，可用PD1, PD2, PD3...进行标记；箭头上方如需要，也可用CT代表催化剂，RG代表试剂等。
- 保存为.cdx文件，以便后续修改。
- 保存为.eps文件，这样才能使LaTeX识别出“标记代码”并进行数字替换。
注意：此处所用的“标记代码”仅对一个特定的.eps文件有代表作用。例如你在图式1中标记苯甲酸为SM1，在图式2中仍然可以使用SM1标记苯酚，图式1和图式2需保存在2个不同的.eps文件。
使用ChemDraw绘制图式之后，如下图所示，其中3种化合物均使用了相应的“标记代码”。然后将其保存为scheme_BenzilicAcid.eps的文件。应当注意的是，所有的文件都应该处于同一个文件夹内。
begin{document}
section{Benzilic Acid Rearrangement} %给内容加上分级标题
Rearrangement of benzil to benzylic acid via aryl migration. %文本部分
begin{scheme}[ht]
schemeref[SM1]{benzil} %将benzil指定给.eps中的“标记代码”SM1
schemeref[RG1]{potassium hydroxide} %将potassium hydroxide指定给.eps中的“标记代码”RG1
schemeref[PD1]{benzylic acid} %将benzylic acid指定给.eps中的“标记代码”PD1
includegraphics[scale=0.8]{scheme_BenzilicAcid.eps} %指定该图式来源于文件scheme_BenzilicAcid.eps
caption{General scheme of benzilic acid rearrangement.} %命名该图示
end{scheme}
end{document}如上操作之后，点击“排版”按钮，我们便可以看到当前的效果了。
描述一个化学反应当然不仅仅需要一个反应通式，还需要相应的反应机理和反应实例，让我们继续加上这些内容，比如说机理部分：
以及反应实例：
begin{document}
section{Benzilic Acid Rearrangement}
Rearrangement of benzil to benzylic acid via aryl migration.
begin{scheme}[ht]
schemeref[SM1]{benzil}
schemeref[RG1]{potassium hydroxide}
schemeref[PD1]{benzylic acid}
includegraphics[scale=0.8]{scheme_BenzilicAcid.eps}
caption{General scheme of benzilic acid rearrangement.}
end{scheme}
subsection{Mechanism} %给内容加上分级标题：机理部分
begin{scheme}[ht]
schemeref[SM1]{benzil}
schemeref[IM1]{nap anion}
schemeref[IM2]{migration anion}
schemeref[IM3]{benzilate anion}
schemeref[PD1]{benzylic acid}
includegraphics[scale=0.8]{mechanism_BenzilicAcid.eps}
caption{Proposed mechanism of benzilic acid rearrangement.}
Final deprotonation of the carboxylic acid drives the reaction forward. %文本部分
end{scheme}
subsection{Example} %给内容加上分级标题：反应实例
begin{scheme}[ht]
schemeref[SM1]{ex_BAR_diones}
schemeref[PD1]{ex_BAR_acidpd}
includegraphics[scale=0.8]{example_BenzilicAcid.eps}
caption{Proposed mechanism of benzilic acid rearrangement.}
end{scheme}
end{document}这样以来，文档看起来就算是比较“饱满”的一页了：
如果调整图式顺序，相应的编号则会自动调整，例如我们把反应实例放在机理的前面：
总结：使用LaTeX进行写作有诸多方便之处。虽然前期会有一定的学习成本，例如各种代码用法的学习和记忆，然而一旦掌握，便会比使用Word更容易达到全身心写作的状态。本文所描述的对于化学文档中结构式的自动编号，大型文档的便利性高于小型文档。比如一篇含有上百个结构式的综述文章或者书籍，使用LaTeX进行自动编号处理则会节省很多后续修改的时间成本。在纯粹的写作过程中，不需要随时使用鼠标来进行功能操作。如果需要预览，可以在完成阶段性的写作之后进行排版，以方便我们后续的写作。
本文属于化学写作系列的一部分，会进行不定期的更新，更新内容则会展示在全文的末尾部分，以方便读者阅览。如在阅读和使用LaTeX进行写作的过程中有疑惑，欢迎与笔者一同探讨，共同进步。
欢迎各位关注，笔者将会不定期发布关于药物化学、有机化学、均相催化与化学写作的一些文字，以期与业内外人士交流学习。
参考文献：
- Joseph Wright, The chemstyle bundle — Schemes and style for chemistry, CTAN, Last accessed August 5th 2019.
- Jie Jack Li, Name Reactions, Springer, Berlin, Heidelberg, 2009.
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