linux的sob目录,Quantum ESPRESSO在Linux下的安装方法

Quantum ESPRESSO在Linux中的安装方法

文/Sobereva@北京科音

First release: 2020-Jul-10  Last update: 2020-Jul-23

1 前言

Quantum ESPRESSO (QE)是用户非常多、极为流行的第一性原理程序，而且完全开源免费。本文介绍一下QE在Linux下的安装过程。本文对于CentOS 7.x系列系统下安装QE 6.5是完全适合的，对于其它QE版本或其它Linux系统请自行尝试、随机应变。本文使用root账户，对于普通用户请安装到自己有读写权限的目录。本文基于OpenMPI库+MKL库+gfortran/gcc编译器进行编译。编译的是纯CPU版本，不支持GPU加速(GPU加速还需要有PGI Fortran编译器)。如果机子里还没装gcc和gfortran，应先用yum install gcc命令进行安装。

在CentOS下使用yum也可以不通过编译来安装，但有一些弊端，见此文第6节。

2 安装OpenMPI

为了让QE能基于MPI并行计算，需要先装MPI库，一般就用OpenMPI。笔者用的是OpenMPI 4.0.3，经测试与QE 6.5完全兼容。

去https://www.open-mpi.org下载最新的OpenMPI包，解压后进入此目录，运行以下命令将之编译并安装到指定目录下。这里笔者安装到了/sob/openmpi目录下。

./configure --prefix=/sob/openmpi

make all install

在~/.bashrc文件中加入以下内容

export PATH=$PATH:/sob/openmpi/bin

export LD_LIBRARY_PATH