python画聚类图_使用seaborn绘制聚类热图

在生物信息领域，无论是基因芯片，RNAseq还是其他各种生信分析里面，差异基因的寻找总是最基础的工作，而热图在差异基因的可视化展示方面占据了独一无二的地位，在这里我将介绍如何使用seaborn库里面的clustermap函数来进行差异基因的可视化展示。

代码

1.导入seaborn等库

import numpy as np

from seaborn import clustermap

import seaborn as sns; sns.set(color_codes=True)

import pandas as pd

2.生成随机矩阵

df1 = pd.DataFrame(np.random.random((1000,10)), columns=["a"+str(i) for i in range(1,11)])#生成随机矩阵1

df2 = pd.DataFrame(np.random.random((1000,10))*2, columns=["b"+str(i) for i in range(1,11)])#生成随机矩阵2

df3 = pd.DataFrame(np.random.random((1000,10))*3, columns=["c"+str(i) for i in range(1,11)])#生成随机矩阵3

#df.rename( index = df["Gene Name"],inplace=True)#设置dataframe的行名

#df.columns=["A1","A2","A3","B1","B2","B3","C1","C3"]#设置dataframe的列名

df