小伙伴们,周末好啊!给大家推荐一波生信入门书籍,这些书可谓是久经考验,系统的利用书籍一定可以使小伙伴们技能迅速提升的!
推荐一共分为三个部分:
“系统基础”
生物信息学处理大数据的特性,我们必然使用linux系统才能高效工作,学习linux是生物信息学学习的“系统基础”。
《鸟哥的Linux私房菜基础学习篇》是最具知名度的Linux入门书,全面而详细地介绍了Linux操作系统。本书内容丰富全面,基本概念的讲解非常细致,深入浅出。各种功能和命令的介绍,都配以大量的实例操作和详尽的解析。本书是初学者学习Linux不可多得的一本入门好书。
“语言基础”
处理大数据我们很难以手动的方式进行分析,因此我们需要学习“语言基础”。目前,生物信息学领域所需的语言为perl或python,两者选其一,R语言为统计作图用途,属于必学语言,另外还有一门awk语言,用于简化日常操作。
1、《153分钟学会R》
这篇文档内容的来源多样,既有来自于 R 官方文档(包括 R_intro,R_data,R_admin), 也有来自于互联网的 contributed documents;还有若干来自于 Capital Of Statistics 论坛的讨论 问题。本文档的目的是为具有一定统计(数学)背景的 R 软件初学者提供一个快速认识 R 软件的 平台。
2、《awk编程语言(中文版)》
本书是由awk语言作者亲自编写的,非常贴近实际,因awk强大的文本处理能力,在生物信息学中,使用awk命令能够大大减少日常工作量。
3、《Learning R》
本书教授学习如何使用R语言和软件环境执行数据分析,即使没有编程经验。通过本实用指南中的教程,您将了解如何使用必要的R工具来分析数据,包括数据类型和编程概念。本书后半部分将通过涵盖从导入数据到发布结果的所有内容,向您展示实际的数据分析。书中的每一章都包括一个关于所学知识的小测验,并以练习结束,其中大部分涉及到写R代码。
4、《Perl语言入门》
《Perl语言入门》也就是大家所称的“小骆驼书”,是启发程序设计人员关于Perl的奥秘之道的一本书。本书由3位在Perl社区中极负盛名的人物共同执笔,他们都有数年教授Perl的经验而且足迹遍布全世界。本书第四版纳入了Perl语言直到Perl语言5.8所做的最新变动。
本书写的深入浅出,清楚透彻,繁简适中。更加吸引人的是全书到处是些小幽默,让你忍俊不禁。使得看书的过程没有一点的枯燥,而是充满了乐趣。这是我看过得最有趣的技术书籍!她没有面面俱到,不是学习perl的手册,但却是极佳的基础入门书籍。
5、python入门
python作为近几年最火热的语言,国内外入门书籍课程非常多,小伙伴们可以根据自己的喜好进行选择。
生物信息学方法论
学习生物信息学,最最难的就是如何入门,如何将所学到的语言用于实际的分析当中,这是接下来推荐的几本书主要讲述的事情!
1、《Bioinformatics with Python Cookbook 2nd》
本书适用于数据数据科学家科学家,生物信息学生物信息学分析师,研究人员和Python开发人员,他们希望使用基于配方的方法解决中到高级的生物和生物信息学问题。期望使用Python编程语言的工作知识。
2、《Bioinformatics with R Cookbook》
本书介绍如何利用R包来处理生物信息学问题,R包不断在更新,但是解决生物信息学问题的思路不变,这本书主要用来学习解决问题的思路。
3、《遗传工作者的生物信息学第二版》
《遗传学工作者的生物信息学(原书第2版)》适合统计学和群体遗传学专业,以及具有分子遗传学和医学遗传学背景的高等院校师生和科研人员阅读,对从事人类及模式生物研究的广大实验室研究人员、临床研究人员以及实验室负责人都有较大的参考意义。
由于本书中文版翻译质量较差,建议大家选择英文版进行学习。
可以把此文分享出去,帮助更多的小伙伴!
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