测序行业的蓬勃发展,带来微生物组学日新月异的变化。目前,单一组学的文章不断“贬值”,前沿研究的目光从单一组学逐步拓展至多组学对贯穿分析,即结合多个组学的分析角度,从多个层面阐述生物学机制。 微生物多组学贯穿分析策略十分丰富:如常见的16s与宏基因组贯穿分析,可以验证物种的特征、丰富功能的探究;而16s与代谢组的贯穿分析思路同样常见于高分文章中,通过16s探究不同处理/环境下菌群的物种组成变化,结合代谢组对应的代谢物的变化,进而找到不同处理/环境下引发细菌丰度差异最终导致代谢表型差异的机制。 参考阅读《选好思路和方法,给自己一篇多组学高分文章》 在16s与代谢组贯穿分析中 ,相关性热图是一个重要的分析手段,主要用于逐一呈现细菌物种与代谢物间的相关性高低,是筛选潜在关联的物种与代谢物的主要途径,对于下游的实验起到指导意义。此类相关性热图在高分文章中频繁出现,足见其重要性(图1、图2)。
图1 物种代谢物热图(2015,Cell Host& Microbe,IF=15.753 )[1]
相关性分析热点图_高分文章中物种与代谢物相关性热图是怎么画的?
本文将介绍在科研中如何进行相关性分析并绘制热点图,提供实用的生信软件教程,解析前沿组学文章,并分享独家视频教程。
摘要由CSDN通过智能技术生成