标准正态分布表完整图查询_R语言统计与绘图：快速绘制临床论文基线特征表1-CSDN博客

1. 前言

怎么快速绘制绘制临床论文中的基线特征表1？

需要用到tableone包。

tableone包是用来创建“表1”（也就是生物医学研究论文中常见的的患者基线特征表），可以在一张表中汇总连续变量和分类变量。

分类变量表示为计数和或百分比，连续变量呈正态分布表示为均值±标准差，呈非正态分布表示为中位数和四分位数。

2. 下载和加载R包

install.packages("tableone")  # 安装包
library(tableone) # 加载包

3. 加载数据集

library(survival)  # 使用survival包的colon数据
data(colon) # 加载数据集

数据集介绍双击这里。

4. 单组汇总

CreateTableOne(data = colon)  # 汇总摘要整个数据集

从上面可以看出，数据集中共有1858例患者，但由于没有将部分变量转化为因子，所以分类变量显示的是均值＋标准差。

5. 分类变量转换

大多数分类变量是用数字编码的，常表示为0、1和2等，因此我们要么在数据集中将其转换为因子，要么是使用factorVars参数进行转换。

通过vars参数指定哪些变量是需要汇总的变量，排除无关变量。

dput(names(colon)) # 输出colon数据集变量名称
输出：
c("id", "study", "rx", "sex", "age", "obstruct", "perfor", "adhere", 
"nodes", "status", "differ", "extent", "surg", "node4", "time", "etype")

从数据集介绍中，我们知道 "rx", "sex","obstruct", "perfor", "adhere", "status"，"differ", "extent", "surg", "node4","etype"是分类变量。

5.1 指定需要汇总的变量

myVars <- c("rx", "sex", "age", "obstruct", "perfor", "adhere", 
            "nodes", "status", "differ", "extent", "surg", "node4", "time", 
            "etype")