github安装_安装GitHub的R包困难解决方案

最新推荐文章于 2024-07-08 14:52:02 发布

weixin_39862794

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文章标签： github安装 github搜索技巧

相信遇到这样的问题的朋友不在少数，在中国大陆做数据分析，下载软件数据文件遇到困难那是家常便饭。

比如安装GitHub的R包，因为并不是所有的R包都会被正式的发布在CRAN或者bioconductor，所以对于简简单单分享在GitHub的R包一般我们搜索到如下代码：

library(devtools)
# https://github.com/jasdumas/shinyGEO 
install_github("jasdumas/shinyGEO")
if(!requireNamespace("ThreeDRNAseq", quietly = TRUE))
  devtools::install_github('wyguo/ThreeDRNAseq')

一切看起来那么美好

函数下载困难就浏览器下载

实际上，在很多地方，上面这样的代码，都只能是永无休止的等待，甚至是如下所示的错误：

其实还可以先下载GitHub的这个R包的项目文件：

当然了，你可能需要找一个网速稍微好一点的下载渠道，如下所示：

然后再本地安装，这个时候install_github函数可能是有问题的啦，所以需要谷歌搜索，考验大家搜索能力的时候到了，主要是关键词寻找：install github local r package 一般来说，程序员之友论坛就会是答案：https://stackoverflow.com/questions/17366772/install-r-packages-from-github-downloading-master-zip

devtools::install('github/ThreeDRNAseq/')

一般来说，就会成功：

另外一个小技巧

实际上，非常多的时候，我们只是记住了R包的名字，而不知道作者，所以下载的时候给出作者+R包名字有点困难，一个 githubinstall 可以根据R包名字帮你联想，just like install.packages().

library(githubinstall)
githubinstall("AnomalyDetection")
Suggestion:
 - twitter/AnomalyDetection  Anomaly Detection with R
Do you want to install the package (Y/n)?

githubinstall() suggests GitHub repositories from input package names and asks whether you install it.

当然了，我觉得没啥意思，我通常是连R包都不记得名字，就是复制粘贴嘛！

不过，这个包自己当然是不仅仅这么一点功能啦，感兴趣的可以去看看：https://cran.r-project.org/web/packages/githubinstall/vignettes/githubinstall.html