linux ab命令安装,ABINIT在Linux下的安装

ABINIT在Linux下的安装

发布时间:2007-10-05 10:01:51来源:红联作者:Revenue

在Linux机器上装ABINIT之前，需确保已经安装了Fortran编译器(g95、pgi或ifc版本的均可)，fftw、blas和lapack数学库。

到目前为止ABINIT最新成熟版本是4.6.4。。它有预先编译好的二进制代码下载(如果想偷懒的话，下载这个解压后，就可以用了)和源代码(自己可以根据自己的机器配置进行安装)。下面就对源代码的安装进行说明：

比如机器A的编译器为pgf90。

1、从ftp://ftp.abinit.org/pub/abinitio/ABINIT_v4.6.4/abinit-4.6.4.tar.gz下载abinit-4.6.4.tar.gz后，解压它：

tar xzf abinit-4.6.4.tar.gz

则得到abinit-4.6.4的目录，下面就是它的源代码、教程、例子和文档说明等。

2、进入Machine_dept_files的子目录Intel_P6，把makefile_macros.PGIstatic_dummy拷贝到上两级目录中：

cp makefile_macros.PGIstatic_dummy ../../makefile_macros

3、编辑修改makefile_macros，修改后的内容为：

##################################

# For the sequential version

# Machine type

MACHINE=P6

# Fortran optimized compilation

FC=pgf90

FFLAGS=-Mextend -Mfree -O2

FFLAGS_LIBS = -O2

FLINK= -Wl,-non_shared

# C preprocessor, used to preprocess the fortran source.

CPP=/lib/cpp

CPP_FLAGS=-P -traditional -DCONTRACT

# C optimized compilation.

CC=cc

CFLAGS=-O

# Location of perl . Used to generate the script fldiff, in ~ABINIT/Utilities .

PERL=/usr/bin/perl

# List of machine-dependent routines

MACHINE_DEP_C_SEQ_SUBS_LIST=etime.o

# Use the ABINIT default libraries.

# For dynamical link, uncomment this line

LIBS= $(LAPACK) $(BLAS) $(NETCDF)

#LIBS=/usr/lib/libgoto_p4_512-r0.96.so Lib_lapack/lapack.a

NC_FC=pgf90

NC_F90=pgf90

NC_CPPFLAGS='-DNDEBUG -DpgiFortran'

#################

4、键入命令：

make allseq

开始编译所有可执行的模块 abinis、 aim 、band2eps、 newsp、 mrgddb、 anaddb 、lwf、 cut3d和conducti等。编译得到这些可执行模块后，将它们拷贝到$HOME/bin目录下，以后就可以直接在所计算的目录运行开始计算了。