c# 路径下的最近文件夹_CentOS 7.6--超算服务器下配置Rosetta_binaries_Linux教程

CentOS7配置Rosetta安装教程

本文在超算平台下的CentOS7(release 7.6.1810)版本下成功测试安装
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安装包下载和超算平台准备

• 在文末会附上作者下载的2020.11预编译好的Linux安装包
• 作者是申请的超算试算平台，大家可以自行查询申请

Rosetta安装

1. 在home下建Rosetta文件夹，将安装包上传至平台，该步非常耗时，安装包18G，耐心等待；
2. 安装Anaconda3，进入终端（Terminal）

wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh #等待下载完成
bash Anaconda3-5.1.0-Linux-x86_64.sh #会有文字提示，已知Enter读完说明
yes #有提示
yes #如果有提示写入.bashrc，输入yes
source  ~/.bashrc
vi .bashrc #如果没有提醒，添加环境变量
export PATH="/public1/home/usernumber/anaconda3/bin:$PATH" #在最后一行添加，然后保存退出
sourece ~/.bashrc  #可通过conda --version 或者python测试是否安装成功

3.解压安装rosetta（预编译版本）

cd Rosetta #进入Rosetta文件夹，安装包放在此处
tar -xvzf rosetta_bin_linux_2020.08.61146_bundle.tgz #耐心等待，此步骤也非常耗时
vi ~/.bashrc #添加Rosetta环境变量
export ROSETTA=/public1/home/usernumber/Rosetta/rosetta_bin_linux_2020.08.61146_bundle
export ROSETTA3_DB=$ROSETTA/main/database
export ROSETTA_BIN=$ROSETTA/main/source/bin
export PATH=$PATH:$ROSETTA_BIN
export LD_LIBRARY_PATH=$ROSETTA/main/source/bin:$LD_LIBRARY_PATH
#请根据自己的文件目录和安装包进行适当的修改，然后退出vi
source ~/.bashrc

4.查看该版本下所有app

cd $ROSETTA/main/source/bin

图1 CestOS7该版本下所有app

测试运行Relax app

参考老师的教程，测试Relax app。

cd $ROSETTA/demos/tutorials/Relax_Tutorial/ #进入Relax文件夹

图2 该文件夹下所有文件

relax.static.linuxgccrelease -s 1ubq.pdb @general_relax_flags #使用默认配置运行

图3 软件正在运行

等待运行完成，在tutorial_output下新生成两个pdb文件，可拖拽到本地电脑，用Pymol或者VMD观察其结构

至此，运行测试结束。

图4 测试产生的新文件

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最后

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Rosetta安装包：baidu网盘，密码：1va2

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