c:if标签多条件的逻辑判断_【计算教程007期】MS建模教程第二期——CIF文件的获取...

本文介绍了如何获取和使用CIF文件进行晶体结构建模,包括从Materials Studio自带数据库、Materials Project、晶体学开放数据库等来源获取CIF,以及在无法获取时如何使用记事本和Materials Studio手动建模的详细步骤。
摘要由CSDN通过智能技术生成
这是MS建模教程第二期,里面会大部分内容讲 如何直接从其他途径获取cif文件。和量化计算不同,周期性计算自己手搭模型真的是下策,一来麻烦,二来麻烦,三来容易出错。 提前做个声明:cif文件可以保存孤立分子信息,但是本文讲的全都是周期性结构。

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CIF是啥 CIF文件是晶体学信息文件,CIF是Crystallographic InformationFile的首字母。它包含了每个晶体的详细信息,如名称、文献、数据库编号、化学组成、晶胞参数、密度、空间群、原子坐标等。更多关于CIF文件格式的信息,参考各种百科或者看看https://www.iucr.org/resources/cif

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假设打开cif总是报错而你又找不到原因,可以用记事本打开cif文件,用里面提供的信息手动建模。

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CIF的获取途径

我按照获取难易程度兼顾资源丰富程度来主观排个序。

直接搜索数据库,你可能会找到一堆的结构信息,如何分辨是不是自己需要的结构信息,需要你提前对自己的做的材料做一个表征,比如XRD。Jade中对照标准谱,然后读取晶胞参数,然后用晶胞参数对照你在数据库中看到的各种结果。

2.1

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Materials Studio自带数据库

具体用法:在project名字上面右击然后import,定位到安装路径下\share\Structures

导入后另存为就好。

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2.2

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Materials Project https://materialsproject.org/

这是个基于第一性原理计算结果的数据库。结构搜索神器,第一性原理计算材料的天堂(刘锦程语)。里面不但有实验结构参数,还有理论计算参数。总之用用你就会收藏的。登陆需要Google账号或者github账号,大家注册一个方便使用。

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