算法介绍
层次聚类(Hierarchical Clustering)是聚类算法的一种,通过计算不同类别数据点间的相似度来创建一棵有层次的嵌套聚类树。在聚类树中,不同类别的原始数据点是树的最低层,树的顶层是一个聚类的根节点。创建聚类树有自下而上合并和自上而下分裂两种方法。
在社会学领域,一般通过给定网络的拓扑结构定义网络节点间的相似性或距离,然后采用单连接层次聚类或全连接层次聚类将网络节点组成一个树状图层次结构。其中,树的叶节点表示网络节点,非叶节点一般由相似或距离接近的子节点合并而得到。
层次聚类方法的基本思想是:通过某种相似性测度计算节点之间的相似性,并按相似度由高到低排序,逐步重新连接个节点。该方法的优点是可随时停止划分,主要步骤如下:
移除网络中的所有边,得到有n个孤立节点的初始状态;
计算网络中每对节点的相似度;
根据相似度从强到弱连接相应节点对,形成树状图;
根据实际需求横切树状图,获得社区结构。
自底向上的合并算法:
层次聚类的合并算法通过计算两类数据点间的相似性,对所有数据点中最为相似的两个数据点进行组合,并反复迭代这一过程。简单的说层次聚类的合并算法是通过计算每一个类别的数据点与所有数据点之间的距离来确定它们之间的相似性,距离越小,相似度越高。并将距离最近的两个数