拆分命令_勘误：一条命令按照物种丰度对OTU表格进行拆分丰富和稀有物种识别...

之前发表了一篇推文给出了如何拆分OTU表格从而得到样本中丰富和稀有物种的方法，前两天在群里有人提出了问题，说是拆分后的表格加回去之后和原始的表格并不一致，这才发现之前的代码存在一定的漏洞。

之前的代码在计算条件稀有物种和条件丰富物种的时候忽略的“在部分样本”中这一条件，从而导致条件稀有物种中含有稀有物种、条件丰富物种中含有丰富物种。

本次更新的代码中对这一问题进行了处理，目前的代码应该是没有问题了，我试验了一下，拆分后得到的6个子表格合并之后与原始的表格是一致的了。

物种丰度划分

我第一次看到物种丰度划分的方法是在北京大学温东辉老师于2016年发表在《FEMS Microbiology Ecology》上的文章，文章是针对杭州湾沉积物的一项研究，提出了按照物种丰度对物种进行划分，从而找到影响微生物群落的关键物种的方法，感兴趣的朋友可以点击文末的“阅读原文”获取该文献。

物种划分方法

在这篇文章中将物种按照其在样本中的检出丰度分为了5类。