老话重提,统计图,和科研领域里的大多数图像数据伴生,是一种大家喜闻乐见的,直观表现数据结果的形式。
只要是个图如果没有伴随统计,reviewers 总会叨叨「请给出统计结果」。加上统计数据的文章看起来的确更具说服力呢!
之前我们推出的第一个教程《手把手教你用软件便捷地数细胞》,既教你认识这个软件 Imaris,又教你怎么数密密麻麻的细胞,区分不同的 marker 阳性的细胞以及计数它们。
那么问题来了,如果有人并不关心细胞数量,而关心细胞的面积,那该如何是好呢?
一般在研究细胞生长时候非常实用,如评估同等量细胞的生长速度,通过比较体外培养细胞的汇合率来得到初步结论;或研究不同类型细胞的表面积,给细胞分型。
举个栗子(为了保护自己的数据隐私,我只是随便拿个废弃的不咋好看的图来演示如何使用软件)
1.打开软件 Imaris,打开图片,在工具栏点击「surface」按钮(红色箭头所示),即可出现如蓝框所示的 Surface 1。
2.让大家看一眼原始的图片,并明确下此行目的:将当前界面红色阳性的区域的表面积计算出来(你也可以计算明场细胞的面积,细胞核的面积 等等)。