化合物相似性搜索_FTrees——Similarity相似性搜索

FTrees简介

FTrees(Feature Trees)是一种高效的药效团模型相似性搜索软件工具，可以促进虚拟高通量筛选(HTS)。特征树描述符捕获分子的整体拓扑结构及其药效团特性。相似性基于两个分子的描述符进行比对。

FTrees主要应用

先导化合物的发现

骨架跃迁：结构不同的分子，具有高度相似的特征树。

高通量筛选分析(HTS)

命中率和正交结果：FTrees在基准数据集上超越了行业标准。

虚拟筛选

化学数据挖掘：能够超高速的从数十亿虚拟化合物中搜索相似骨架。

参考资料

[1]   Hans Briem, Uta F. Lessel. In vitro and in silico affinity fingerprints: Finding similarities beyond structural classes. Perspectives in Drug Discovery and Design, 2000, 20 (1), 231-244

[2]   Thierry Kogej, Ola Engkvist, Niklas Blomberg, Sorel Muresan Multifingerprint based similarity searches for targeted class compound selection. Journal of Chemical Information and Modeling, 2006, 46 (3), 1201-1213

[3]   Markus Böhm, Tong-Ying Wu, Holger Claußen, Christian Lemmen Similarity Searching and Scaffold Hopping in Synthetically Accessible Combinatorial Chemistry Spaces. Journal of Medicinal Chemistry, 2008, 51 (8), 2468-2480