python存储序列_Python-Dicom图像自动按照扫描序列分类储存

本文介绍了如何使用Python将混杂在一起的DICOM医学图像按照不同的序列(如T1、T2、DWI、ADC等)进行分类和存储。通过读取每个文件的SeriesDescription,创建相应的文件夹并将图像复制到对应的位置。
摘要由CSDN通过智能技术生成

最近处理实验室数据,遇到新的需求:每个病人的每次MRI的多张dicom图像按照所属的序列自动分类存储,并提取出想要的序列;But原始影像所有dicom文件都是在一起的,如下图所示。

image.png

image.png

所有序列都是混乱在一起的

用MicroDicom viewer打开整个文件夹能够到清晰的序列结构:

image.png

localizer为定位序列,t2_tse_tra_fs为t2序列,t1_tse_tra为t1序列,

ep2d_diff_tra_spair为DWI序列(扩散加权成像),ep2d_diff_tra_spair_ADC为ADC序列,t1_fl3d_tra_dyna_1+5_NEW为增强序列(后面为注射完对比剂后5个不同时间的增强序列)

在网上找类似的程序实现,只找到matlab代码,python实现的没找到,自己根据其思路用python实现了想要的结果。

1.导入需要的包

import glob

import os

import pydicom

import shutil

import re

2.读取一个文件夹里面全部的dicom文件

#待处理的原始影像文件路径

InFolderName = 'D:/FinishedDataTotal/part3_3.0T/2019-12-11/002257

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