python正则表达式模糊匹配_用python正则表达式编译模糊正则表达式

当我发现python regex模块可以进行模糊匹配时,我感到非常高兴,因为它似乎是解决我许多问题的简单方法.

但是现在我遇到了一个问题,我没有从文档中找到任何答案.

如何使用新的模糊性值功能将字符串编译为正则表达式？

为了说明我通常的需求并给出一些示例代码

import regex

f = open('liner.fa', 'r')

nosZ2f='TTCCGACTACCAAGGCAAATACTGCTTCTCGAC'

nosZ2r='AGGTCACATCAACGTCAACG'

#nini=regex.compile(nosZ2r{e<=3})

nimekiri=list(f)

pikkus=len(nimekiri)

count = 0

while (count < pikkus):

line = nimekiri[count].rstrip('\n')

m=regex.findall("(TTCCGACTACCAAGGCAAATACTGCTTCTCGAC){e<=3}", line)

n=regex.findall("AGGTCACATCAACGTCAACG{e<=3}", line)

if bool(m) & bool(n):

print nimekiri[count-1].rstrip('\n')

print line

count = count + 1

f.close()

如您所见,带有3个错误的模糊性的正则表达式可以正常工作.但是我被迫手动将整个字符串(nosZ2f / r)输入到findall中.

我无法使用错误/模糊度值编译正则表达式.

将字符串(行号nosZ2f / r)转换为模糊度值为3错误的正则表达式的正确语法是什么？ (在注释行看到的尝试失败)

对于我想到的任何实际有用的脚本,使用输入字符串作为regexp的源的可能性至关重要. (否则自动化程度不高)

所以,如果我能做些烦恼,我会很高兴.更换

m=regex.findall("(TTCCGACTACCAAGGCAAATACTGCTTCTCGAC){e<=3}", line)

与

m=regex.findall(nini, line) etc.

要么

m=regex.findall("string{e<=3}", line)

解决方法:

您需要正确地将字符串放在一起.

import regex

testString = 'some phrase'

r = regex.compile('('+testString+'){e<=5}')

r.match('phrase')

如果要构建正则表达式模式,则需要使用各种字符串操作技术来构建要使用的适当模式.

标签：fuzzy-search,pypi-regex,python,regex