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RSS订阅原创 高斯过程与高斯分布什么关系？
1. 命名高斯：高斯分布过程：随机过程定义：定义在连续域上的无限多个高斯随机变量组成的随机过程。2. 与高斯分布的关系？概率密度函数一维高斯分布p维高斯分布…高斯过程无限维的高斯分布3. 高斯过程的2大核心要素高斯过程表示如下：其中，高斯过程有2个核心要素：均值函数 m(t) 和核函数 k(t,s)。如下表所示，对比了p维高斯分布和高斯过程（无限维高斯分布）在2大核心要素的区别和联系。类型核心要素符号维
2022-05-17 22:56:26
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原创 mac 终端修改单个文件名
1. 问题描述mac系统如何直接在终端下修改单个文件名？如下所示为该文件夹下的table文件，将文件名"我的文件.csv"修改为“my_file.csv”ls我的文件.csv2. 解决方案使用“mv 文件a 文件b”来对单个文件名进行修改，如下所示：mv 我的文件.csv my_file.csv结果如下：lsmy_file.csv完结撒花！...
2020-12-02 11:28:33
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原创 Latex表格内容自动换行
1. 问题描述使用Latex写表格时，内容过多会超出页面边界，为了美观和内容完整，我们经常会需要用到换行功能。如上图所示，2行3列李四的评论，由于过长，没有完全显示，一定程度上影响美观。为达到下图效果。如何来给该行换行？2. 解决方案原始表格对应的Latex代码如下：\begin{table}[h]\centering\begin{tabular}[H]{|c|c|l|}\hline1 & 张三 & 我我我我我我我我我我我我我我我我我我我\\\hline2 &a
2020-11-18 23:08:35
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原创 大脑表面的叶和其他标志性结构
该内容来自于Neuroscientifically Challenged系列课程视频，本文主要做翻译以及内容整理补充。在该博客中，我们分为3部分来介绍大脑表面的叶和其他标志性结构。序号主要内容1脑表面的基本结构2脑表面的叶和其他标志性结构3不同脑组织的基本功能1. 脑表面的基本结构大脑由两半组成，称为脑半球(cerebral hemispheres)。当从侧面看大脑时，我们只会看到一个大脑半球，而我们接下来讲到的结构在2个大脑半球都可以找到。脑半球的表
2020-11-06 17:48:56
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原创 γ-氨基丁酸GABA(gamma-aminobutyric acid)
该内容来自于Neuroscientifically Challenged系列课程视频，本文主要做翻译以及内容整理补充。在该博客中，我们分为5部分来介绍神经递质(neurotransmitter)γ-氨基丁酸GABA。序号主要内容1GABA的定义2GABA的作用3GABA的合成4GABA的受体5GABA的移除1. GABA的定义γ-氨基丁酸(gamma-aminobutyric acid)，也称作GABA，是人类神经系统中主要的抑制性神经递质。它
2020-11-04 23:12:21
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原创 谷氨酸Glutamate
该内容来自于Neuroscientifically Challenged系列课程视频，本文主要做翻译以及内容整理。在该博客中，我们分为5部分来介绍神经递质(neurotransmitter)谷氨酸能。序号主要内容1谷氨酸的定义2谷氨酸的作用3谷氨酸的合成4谷氨酸的受体5谷氨酸的移除1. 谷氨酸的定义谷氨酸是人类神经系统的主要兴奋性神经递质。 它是一种氨基酸神经递质，可与离子和代谢型受体相互作用。2. 谷氨酸的作用谷氨酸通常具有兴奋作用(e
2020-11-02 16:38:55
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原创 突触传递synapse transmission
该内容来自于Neuroscientifically Challenged系列课程视频，本文主要做翻译以及内容整理。在该博客中，我们主要分为以下4个部分来介绍突触传递(synapse)。序号主要研究内容1突触间隙2神经递质的释放3与受体的相互作用4从突触间隙清除神经递质的方式1. 突触间隙突触是两个神经元彼此足够接近的区域，神经元之间的大多数通信发生在名为突触的特殊结构上，它们能够将化学信号从一个细胞传递到另一个细胞。如上图所示，神经元实际上并没
2020-10-19 16:29:58
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原创 癫痫epilepsy
该内容来自于Neuroscientifically Challenged系列课程视频，本文主要做翻译以及内容整理。在该博客中，我们分为4部分来介绍一种反复发作的慢性疾病癫痫(epilepsy)。1. 癫痫的定义癫痫病是一种反复发作的慢性疾病。癫痫发作是由于过度的神经活动，引起正常大脑活动被暂时破坏。癫痫病可能有遗传原因和后天原因，但在大多数情况下原因尚不清楚。且根据患者的不同，癫痫发作的外观可能会截然不同，从短暂而细微的意识中断到剧烈的抽搐不等。2. 癫痫发作的原因如下图所示，在健康的
2020-10-16 15:41:29
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原创 5-羟色胺(serotonin)
在该博客中，我们分为4部分来介绍神经递质(neurotransmitter)5-羟色胺。5-羟色胺的合成 synthesis5-羟色胺产生神经元的主要位置 the primary location of serotonin-producing neurons5-羟色胺的受体serotonin receptors5-羟色胺的功能functions of serotonin一. 5-羟色胺的合成5-羟色胺是一种单胺类的神经递质，其化学结构以，其衍生自一种氨基酸。为了合成5-羟色胺，色氨酸
2020-10-14 21:59:15
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原创 什么是蛋白质结构域？什么是HTH？
1. 什么是蛋白质结构域？结构域是蛋白质三维结构中小的保守区域，展示了蛋白质功能的属性，是构成蛋白质（三级）结构的基本单元，结构域检测是蛋白质分类和功能注释的重要方面。蛋白质结构域与蛋白质完成生理功能有着密切的关系，有时几个结构域共同完成一项生理功能，有时一个结构域就可以独立完成一项生理功能，但是一个结构不完整的蛋白质结构域是不可能产生生理功能的。因此蛋白质结构域是蛋白质生理功能的结构基础，但必须指出的是，虽然蛋白质结构域与蛋白质的功能关系密切，但是蛋白质结构域和功能域的概念并不相同。2. 什么是HT
2020-09-09 12:56:17
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原创 什么是Crispr系统？Crispr如何在免疫系统中发挥作用？
博主系计算机专业生物信息方向，近来被boss安排来做anti-crispr预测问题，从了解CRISPR机制开始，在文献+各类讲解视频的轰炸下，略有收获（感受到了来自不同学科的学习乐趣，逃。。），写一篇博客来记录一下自己对CRISPR的理解。1. 背景及应用CRISPR技术是一种强大的基因组编辑工具，省时间且编辑精度高，被广泛应用于各类生物学问题研究中，对于生物学家了解生物体内的代谢过程, 生物体内基因的功能研究和现代基因治疗都有着至关重要的作用。2. CRISPRCRISPR技术是细菌体内的获得性免
2020-09-03 00:44:41
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转载 matlab文件路径
matlab文件路径中的各种.的含义序号符号含义1.表示当前目录2…表示当前目录的上一级目录3./表示当前目录下的某个文件或文件夹，视后面跟着的名字而定4…/表示当前目录上一级目录的文件或文件夹，视后面跟着的名字而定...
2020-06-09 17:03:25
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原创 Python3 中6个数据类型的标识符及是否可变
1. Python3 中六个标准的数据类型Python3 中有六个标准的数据类型：Number（数字）、String（字符串）、List（列表）、Tuple（元组）、Set（集合）和Dictionary（字典）。2. 不同数据类型是否可变及标识符序号数据类型是否可变数据类型标识符1Number（数字）不可变数据支持 int、float、bool、complex（复数）2String（字符串）不可变数据用单引号 '或双引号" 括起来，用反斜杠\转义特殊字符
2020-06-08 17:46:58
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原创 Python3 16进制转10进制
1. 问题描述已知数值为16进制，将其转化为10进制。2. 解决方案Python3自带了函数直接将其他进制转化为10进制，以下分别为调库和自己实现2种方式。2.1 直接调库#输入为stringvalue = int(string,16)2.2 自己实现def conv(string): my_dict = {"A":10, "B":11, "C":12, "D":13, "E":14, "F":15} li = [] line = string.strip()[2:]
2020-05-30 17:07:58
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原创 Python将字符串按照固定长度分割
1. 问题描述将已知的字符串string按照固定长度分割，假设这里的固定长度为5。2. 解决方案import restring = "asdfghjklqwertyuiop"st = re.findall(r'.{5}', string)print(st)输出如下，且最后不足5位的，直接舍弃。这里使用了re模块的findall函数：re ：这个模块提供了正则表达式匹配操作，正则表达式是一个特殊的字符序列，它能帮助你方便的检查一个字符串是否与某种模式匹配。re.findall：fin
2020-05-29 10:44:09
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原创 牛客网-明明的随机数（输入多组随机数，去重并排序）
1. 问题描述明明想在学校中请一些同学一起做一项问卷调查，为了实验的客观性，他先用计算机生成了N个1到1000之间的随机整数（N≤1000），对于其中重复的数字，只保留一个，把其余相同的数去掉，不同的数对应着不同的学生的学号。然后再把这些数从小到大排序，按照排好的顺序去找同学做调查。请你协助明明完成“去重”与“排序”的工作(同一个测试用例里可能会有多组数据，希望大家能正确处理)。注：测试用例保证输入参数的正确性，答题者无需验证。测试用例不止一组。输入描述: 输入多行，先输入随机整数的个数，再输入相应
2020-05-29 10:05:23
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原创 从几何角度解析线性回归模型，并进行参数估计
线性回归定义：对回归问题，构建线性模型拟合，并进行参数估计。1. 线性回归模型-数据介绍数据集Data={(x1,y1),(x2,y2),...,(xN,yN)}Data=\left\{(x_1,y_1),(x_2,y_2), ... ,(x_N,y_N)\right\}Data={(x1,y1),(x2,y2),...,(xN,yN)}其中，X是N行p列的矩阵，共有N个样本，p...
2020-04-30 23:09:52
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原创 贝叶斯公式的理解及简单推导
1. 贝叶斯概念理解如下为贝叶斯公式，其中P(A)为事件A的先验概率，P(A|B)为事件A的后验概率，且后验概率的计算融合了先验概率的值。P(A∣B)=P(B∣A)∗P(A)P(B) P(A|B)=\frac{P(B|A)*P(A)}{P(B)}P(A∣B)=P(B)P(B∣A)∗P(A)这里的事件B可以理解为证据，事件A可以理解为待推理的事件，后验概率P(A|B)是在给出事件B作为证据的基...
2020-04-16 21:11:49
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原创 Latex如何在表格下方显示注脚
1. 问题描述如下图所示，使用Latex输出如下样式的表格，需要在表格下方加入注脚，如何操作？原始表格的代码如下：\begin{table}[] \begin{tabular}{cccc} \hline & B1 &B2 & B3\\ \hline A1 & 0.1 & 0.2...
2019-12-27 23:12:22
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原创 Latex多个连续参考文献引用，使用破折号
1. 问题描述用Latex写参考文献，多个连续的引用一个个写出，没有用破折号显得冗余，如下图所示：2. 解决方案在Latex的load packges部分导入cite包 \usepackage{cite}运行后结果图如下：问题解决，完结撒花！...
2019-12-27 22:16:39
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原创 Latex如何给公式编号
1. 问题描述Latex公式已写好，如何得到如下图所示编号2. 解决方案\begin{equation}\公式代码（例子：Omega\left(f_{t}\left(X_{i} ; \theta\right)\right)=\gamma T+\frac{1}{2} \lambda\|w\|^{2}\end{equation} ...
2019-12-26 22:00:35
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原创 mac如何将word中的公式转为latex格式
1. 问题描述这几天因论文投稿需求，要把写好的word文档转为Latex格式，公式繁多且部分复杂难写，一个一个敲过来的话简直丧心病狂，费时费力容易犯错。2. 常见解决方案看了其他几个博客，解决方案主要以下几种：Office word安装Mathtype，可在Mathtype一栏直接选择格转换为Latex。参考博客链接高版本Office word以及office365自带了Equatio...
2019-12-26 20:59:53
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原创 latex中如何处理下划线和百分号
1. 问题描述Latex中直接使用下划线_和百分号%，因与系统默认功能相冲突，会报错或者损失信息。2. 解决方案在使用会报错的符号时，可以在符号前加入\原始符号修改后_\_%\%简单粗暴，问题解决。...
2019-12-25 22:10:37
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原创 时间复杂度计算--求两正整数最大公约数
1.计算时间复杂度的基本流程时间复杂度计算主要分为3个步骤：先找出算法的基本操作计算基本语句的执行次数的数量级用O记号表示算法的时间性能2. 求两数最大公约数问题描述：求a, b两正整数的公约数。相关定理：已知a,b,c为正整数，若a除以b余c，则（a,b）=(b,c)。该方法名为欧几里得算法（辗转相除法），伪代码如下：function Euclid(a,b)1:if ...
2019-12-01 15:13:27
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原创 算法学习weekly schedule
1. 背景虽说是在做搞算法，但至今仍未对算法的深层次学习很迷茫，明年申请计算机专业博士，急需系统补一波算法理论，学习计划及全部资料均来源于中科院算法教授卜东波老师，跪谢了，附上课程资料地址。2. weekly ScheduleweekthemeLecture numberlectuure themeWeek1-3Introduction to algorithm a...
2019-11-29 21:56:00
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原创 git操作大全(1)
1. 创建clone一个已有的库$ git clone ssh://user@domain.com/repo.git创建一个新的库，把当前文件夹变成git可以管理的库git init2. 本地的改变查看状态Changed files in your working directory$ git status查看区别Changes to tracked files...
2019-11-24 20:33:47
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原创 使用git管理github代码
1. github代码管理方式众所周知，很多人会选择github平台来管理项目及相关代码，主要分为两种方式。最简单粗暴的方式就是直接菜单栏上传，如下图所示，可以直接新建文件或上传。使用git命令管理github首先建立本地git库，再将本地库和远程库做关联，更高效且实时地管理远程库。2. 安装并配置git2.1 安装git该类教程很多，此处仅简单介绍mac系统使用home...
2019-11-20 23:57:30
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原创 git与svn的区别
git与svn的主要区别：git是目前最流行的分布式版本控制系统，而svn则是典型的集中式版本控制系统。这里的集中式和分布式，主要区别在与历史版本的保存位置，集中式的历史版本仅保存于中央服务器，且每次提交或下载只能通过中央服务器，而分布式的历史版本通过pull和push命令可同时保存更新到本地库。主要区别集中式版本控制系统分布式版本控制系统历史库存放位置集中存放在...
2019-11-20 20:49:58
132
原创 连接服务器报错1:ssh_exchange_identification: Connection closed by remote host
1. 报错内容ssh访问服务器时，得到以下问题报错：ssh_exchange_identification: Connection closed by remote host之前登陆没问题，今天突然出现该连接问题。2. 解决方案1、CVM安全组、防火墙 iptables、firewalld 等是否有对源地址的限制2、检查 /etc/hosts.deny 和 /etc/hosts.all...
2019-11-18 21:47:34
2821
原创 文献管理软件Mendeley的使用
1. Mendeley简介Mendeley是一款免费的文献管理软件，同时也是一个在线的学术社交网络平台，且有自己的社区，使用人数日趋增加。下载mendeley可直接官网自取，Windows、Linux和Mac系统下载安装都有，运行起来方便简单，目前已提供手机端。2. Mendeley页面及主要功能介绍2.1 界面介绍安装好的Mendeley打开后，界面如下，主要分为菜单区、搜索框、分...
2019-11-18 13:11:25
7422
原创 vim编辑器的常用指令
闲来无事，系统学习一波牛皮的vim编辑器，多为简单常用的操作。vim编辑器主要分为三种模式：一般模式，编辑模式和命令行模式，本文将对此三部分常用指令做介绍。1. 一般模式在一般模式中，可以进行删除、复制和粘贴的功能，但是无法编辑文件内容。在一般模式中输入：、/、？三个中的任意一个可以将光标移到最下面的一行。在这个模式中可以提供查找数据的操作，读取、保存、大量替换字符、离开vii、显示行号...
2019-11-17 18:13:53
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原创 服务器常用操作
1. 了解服务器的基本信息1.1 显示系统信息首先输出计算机完整系统信息，输出依次为：操作系统名称 + 计算机名 + 操作系统发行编号 + 系统时间 + 计算机类型uname -a# 输出Linux 104 4.4.0-87-generic #110-Ubuntu SMP Tue Jul 18 12:55:35 UTC 2017 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linu...
2019-11-06 02:21:31
258
原创 mac使用pyenv安装和管理多个python版本
1. 背景众所周知，很多系统内置Python2，而我们多使用Python3版本，不可避免的我们会安装双版本甚至多版本的python。pyenv应运而生！pyenv：一个高效的Python版本管理工具，安装并管理多个版本的Python。pyenv 解决的是同一个系统中不同版本的 python 并存的问题，而 pyenv-virtualenv 解决的是不同项目所依赖的软件包之间可能产生冲突的问题...
2019-11-05 16:07:55
990
1
原创 mac上python安装xgboost
首先奉上xgboost官方文档python安装详细步骤地址，试过其他帖子的步骤，没能成功安装，官方文档可以的。1. 为什么Python直接使用pip3安装会报错？1.1 使用pip3安装xgboost如下，直接使用万能的pip3 install xgboost在python中安装xgboostpip3 install xgboost1.2 报错运行包含训练xgboost模型的代码...
2019-11-04 22:56:35
11532
16
原创 Python中，matrix是否只可以存储数值型数据？
Python语言下，matrix是否只可以存储数值型数据？理论上来说，absolutely！但是数据类型间转换除外！1. 存储string的list转换为matrix众所周知，matrix只能存储数值型数据，而以下代码却可将存储string的list强行转变为matrix，并无报错。# 新建list存储多个字符串m = ['ab','bc','cd']print(type(m))pri...
2019-10-16 15:48:54
580
原创 Python字典与集合的异同点
字典与集合的异同点不同点字典集合创建{key:value}set([key]) 或 {}主要用途需要对元素进行标记的对象（不需要记住对应位置）去重、计算交集，并集，差集，反交集等是否可以索引可以不可以是否有value每个key对应一个value无对应的value相同点均有key值，且key值不重复不可放入可变的...
2019-10-16 11:33:11
8198
原创 matlab元胞数组
元胞数组矩阵只适合存放和处理若干相同类型的数据，要想同时存放和处理多种类型的数据就需要用元胞数组。1. 元胞数组的创建用“{ }”来创建，以区别创建矩阵的“[ ]”。(1) 赋值语句创建a = {'hello' [1 2 3; 4 5 6]; 1 {'1' '2'}} %创建2×2的元胞数组，%同行元素间用“, 或空格”隔开%行与行间用“;”隔开%第1行第1列的元胞，存放字符...
2019-10-16 00:03:20
1651
原创 线性与非线性的理解
1.问题的线性非线性理解的区别：现有的样本点能否在输入空间上，用线性超平面区分；2.模型的线性非线性基础数学说，线性指变量之间的数值关系，即满足成比例。因此，变量之间的多项式、指数等关系都算是非线性。网上有一批文章认为，ML 模型的线性非线性，指模型参数之间的关系，即决策函数 y=w_1x_1^2 + w_2x_2^2 是线性模型，而 y=w_1^2x_1 + w_2^2x_2 是非线性模...
2019-10-15 23:49:58
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原创 csv、txt和tsv数据文件的异同点，以及如何使用Python读取和生成
本文主要分为两部分：csv、tsv和txt格式数据文件的异同点；如何用Python读取/生成不同格式的数据文件。一. csv、tsv和txt格式数据文件的异同点相同点： csv、tsv和txt都属于文本文件。不同点：csv和tsv文件的字段间分别由逗号和tab键隔开，而txt文件则没有明确要求，可使用逗号/制表符/空格等 多种不同的符号。文件类型全称字段间的分隔符...
2019-10-14 21:10:22
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空空如也
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