c 两个rect 重叠面积_ggplot2绘图学习 两个连续性变量

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为了系统的学习ggplot2绘图，我们昨天从单变量的绘图开始，使用数据集mpg，展示ggplot2绘制单变量图形，今天我们学习两个连续性变量的绘图方式。

双变量：两个连续变量

geom point(): 散点图 geomsmooth(): 平滑线 geom quantile(): 分位线 geomrug(): 边际地毯线 geom jitter(): 避免重叠的点 geomtext(): 文本注释

首先构建一个图层，用mpg数据的cty和hwy做图

library(tidyverse)
f <- ggplot(mpg, aes(cty, hwy))

散点图

f + geom_point()

按照year分组，赋予点的颜色和形状。

f + geom_point(aes(color=year))

由于year是数字，需要转化成因子，否则会被认为是连续性变量。将shape赋予连续性变量会报错。

f + geom_point(aes(color=factor(year),shape=factor(year)))

我们可以用scale_color_manual自定义颜色

f + geom_point(aes(color=factor(year),shape=factor(year)))+
  scale_color_manual(values = c('2008'='red','1999'='blue'))

添加回归曲线

f + geom_point(aes(color=factor(year),shape=factor(year)))+
  scale_color_manual(values = c('2008'='red','1999'='blue'))+
  geom_smooth(color='black',fill='green')

se=FALSE去点置信区间

f + geom_point(aes(color=factor(year),shape=factor(year)))+
  scale_color_manual(values = c('2008'='red','1999'='blue'))+
  geom_smooth(color='black',fill='green',se=FALSE)

不同分组分别绘制回归曲线

f + geom_point(aes(color=factor(year),shape=factor(year)))+
  scale_color_manual(values = c('2008'='red','1999'='blue'))+
  geom_smooth(aes(color=factor(year),shape=factor(year)),se=FALSE, method = "lm")

添加分位线

f + geom_point()+geom_quantile()

添加边际地毯线

f + geom_point()+geom_rug()

通过上面赋予不同分组不同形状的图，我们发现这些点其实是由重叠的，我们可以添加抖动防止重叠

f + geom_jitter()

width参数控制x轴方向的抖动幅度，height参数控制y轴方向的抖动幅度

文本注释

f + geom_text(aes(label = cty))

单基因泛癌分析链接

TCGA单基因免疫相关泛癌分析（应要求，对出图添加更细致的描述）​mp.weixin.qq.com

TCGA单基因免疫相关泛癌分析-进阶版本​mp.weixin.qq.com

公众号“生信小课堂”

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生物信息学教学​m.study.163.com