记录：R_GEOquery下载超时

最新推荐文章于 2024-12-14 16:02:56 发布

weixin_42265295

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使用getGEO下载成功，但超时未下载完全

gse=getGEO("GSE37460",destdir = ".")
Timeout was reached: [] Operation timed out after 120000 milliseconds with 2244608 out of 3388891 bytes receivedFile stored at:

原因是curl设置了总超时时间

curl::curl_options("timeout")

         accepttimeout_ms          ca_cache_timeout            connecttimeout 
                      212                       321                        78 
        connecttimeout_ms         dns_cache_timeout     expect_100_timeout_ms 
                      156                        92                       227 
happy_eyeballs_timeout_ms   server_response_timeout                   timeout 
                      271                       112                        13 
               timeout_ms 
                      155

使用curl_options()无法修改timeout，问题目前未解决