
采用circlize包绘制Circos图
本文采用circlize包自带的示例数据绘制Circos图,简要描述了circlize包的绘图思想和原理,以及几个常用参数的作用。
Circos图(圈图)功能
可展示的数据:基因密度、基因功能注释、CG含量、突变频谱、CNV分布、组蛋白修饰、甲基化密度、转座子与顺式调控元件分布等等;
组学可涉及:基因组、外显子组、甲基化组、ATAC-Seq和ChiP-Seq等组学等等;
复杂度可包括:多个样本、多个组织,多个时期的组学数据;
图的类型可涵盖:(复杂)热图、散点图、密度图、折线图、(堆积)



