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原创 生信实证系列Vol.15:如何用AlphaFold2,啪,一键预测100+蛋白质结构
这么多机器和任务,怎么适配,按什么策略使用最佳,怎么配置、启动、关闭,提高整体资源利用率,最好还能自动化管理、辅助管理决策等等,甚至怎么DEBUG,这需要的可不止是一点点技术。(cross-distillation)方法,把AF2预测的结构数据预添加到AF3的预训练集中,减少AF3的预测失误。如果用户想要自行使用,不但要下载庞大的数据库,还需要自行搭建使用环境,对IT能力的要求不可谓不高。利用已知的蛋白质序列和结构模板,获得不同蛋白质之间的共有进化信息来提升目标蛋白质结构预测的准确性。
2024-06-24 14:13:04
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原创 今日上新——FCP
今年2月,我们专门满足用户对高性价比的稀缺大机型需求。产品研发组的小伙伴们根本停不下来~才几个月,我们又又上新了!今天的新品是(fastone Compute Platform),我们的,主要面向的是已经有本地研发环境,但依然为一些问题而头疼的用户——本地为什么这么低??,怎么搞?加机器?扩存储?集群化??没有经验?无法使用?仿真Case异常退出?验证出现中断?项目高峰期或冲刺期,,不掉链子?有成熟稳定大规模实践的吗?上市成熟企业如何和?
2024-05-27 14:51:50
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原创 CAE实证Vol.14:超大内存机器,让你的HFSS电磁仿真解放天性
由Ansoft公司在1990年开发并发布第一个版本。2008年,Ansys收购了Ansoft,继续开发HFSS等电子与电磁仿真产品,目标是解决整个工业体系中机械与电气领域的持续融合问题。现在的HFSS,已经成为天线、射频RF或微波组件、高速互连、滤波器、连接器、IC封装、PCB设计者必不可少的工具。世界各地的工程师使用 Ansys HFSS 软件来设计通信系统、高级驾驶辅助系统 (ADAS)、卫星和物联网 (IoT) 产品中的高频高速电子设备。HFSS作为一款。
2024-04-22 14:53:09
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原创 【案例】只做Best in Class的必扬医药说:选择速石,是一条捷径
03必扬医药(Beyang Therapeutics),成立于2021年,是一家既年轻又成熟的Biotech公司。基于(Experiment + Computation w/ Enhanced Evaluation & DMPK)技术平台,必扬专注于计算模拟技术和药物发现实验技术的高度融合,寻找更快、更智能的方法来发现新的和更好的药物。基于多年在行业深耕的经验和独特的创新视角,胡齐悦在2021年创立了必扬医药。他的初衷是:“我希望必扬作为。
2024-03-20 16:02:13
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原创 从“单打独斗”到“同舟共集”,集群如何成为项目研发、IT和老板的最佳拍档?
我们致力于构建为应用定义的云,让任何应用程序,始终以自动化、更优化和可扩展的方式,在任何基础架构上运行。希望和你共同建立持续迭代的多云世界观。说出你的应用,我们就有故事~~
2024-01-19 11:09:46
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原创 【案例】光电兼修的Alpha Cen,如何应对上升期的甜蜜烦恼?
Alpha Cen(比邻星光)是一家挺酷的公司,专注于研发。所谓超表面芯片,就是。用微纳光学超表面技术能够平面化集成唯一还不在wafer上的光学器件,这意味着,在同一家Fab厂里可以制造完成一个,且更轻便,更智能。既要掌握光,又要掌握电,做;既掌握了主动式超表面技术,还掌握了被动式;,需要自己开发;技术壁垒极高,之前没有人做过,未来的有些应用领域现在甚至无法想象。Alpha Cen的两位创始人,都喜欢做一些有挑战性的事情。一位精通光学领域,一位精通电学领域,多年老友,一拍即合。
2023-09-15 16:01:04
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原创 未来芯片设计领域的药明康德——青芯如何在N个项目间游走平衡
总部位于上海张江的是其核心业务之一。青芯在单纯的设计服务维度之上,打造了从设计到生产的一套完整ASIC定制业务,不仅做芯片设计,还提供封装、测试服务,也包括生产端的验厂和品控等环节,甚至能根据供应链和制造端的实际情况来反向调整和优化芯片设计阶段的工作。未来,青芯希望在ASIC定制设计领域为客户提供顶级的设计支撑,帮助客户实现其产品的成功。创始人杨浩做了个类比:“。
2023-08-31 16:40:30
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原创 国产调度器之光——Fsched到底有多能打?
Synopsys、Cadence与Siemens等公司纷纷在其最新工具中使用了AI技术,覆盖先进数字与模拟芯片的设计、验证、测试和制造环节,让开发者在芯片开发的每一个阶段都可以采用借助AI的自主学习能力,提供芯片设计生产力。Ta是面向HPC集群的操作系统,是HPC集群的“大脑”,用于对HPC集群内的计算资源进行管理、监控,对用户提交的任务进行统一管理、分发和远程执行。我们致力于构建为应用定义的云,让任何应用程序,始终以自动化、更优化和可扩展的方式,在任何基础架构上运行。我们首先需要定位与任务相关的日志。
2023-08-25 09:29:31
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原创 研发/IT工程师双视角测评8大仿真平台,结果……
出发,讨论了8种平台/方案的产品模式、兼容性、支持的CAE仿真软件、底层资源量与类型、计费模式等信息。今天,我们将更进一步,从。
2023-05-17 15:30:18
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原创 我们决定随机选个区域直接送钱!!!
💰活动规则:消费500送200,消费50000送20000,上不封顶(体验金除外)既符合公司气质、看上去很贵、又真正给用户实惠的“直接送钱”活动❗❗❗。在否决了CTO至尊服务、助力打工人梦想、第一瓶茅台三大方案后。🕚活动日期:即日生效至2023年5月5日。不仅有☝️Intel,还有✌️AMD机型。我们会派出“大红大紫”组合提供专属服务!提供最高至8张卡的V100机型。可评论或私信📱输入暗号“送钱”📦适用产品:全产品线!我们最终选择了一个——🌍适用人群:所有用户。感兴趣的用户🙋♂️。望大家奔走相告❗❗❗。
2023-03-14 14:22:59
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原创 芯片设计五部曲之二 | 图灵艺术家——数字IC
数字IC设计工程师的设计目标:在PPA(Power、Performance、Area)三个指标上追求完美的平衡。怎么玩转这门科学?这,是一种艺术。
2023-01-12 17:47:20
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原创 生信云实证Vol.12:王者带飞LeDock!开箱即用&一键定位分子库+全流程自动化,3.5小时完成20万分子对接
LeDock是苏黎世大学Zhao HongTao在博士期间开发的一款分子对接软件,专为快速准确地将小分子灵活对接到蛋白质而设计。LeDock优于大部分商业软件,在Astex多样性集合上实现了大于90%的构象预测准确度,对接时间最快仅需三秒。
2022-09-13 16:36:53
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原创 解读Hyperion年度报告:脱离场景谈用量就是耍流氓
今年Hyperion Research的年度HPC市场报告,“应用”这个维度第一次出现并独立成篇了。而去年,是Cloud HPC第一次正式拥有席位。我们发誓,上头真没人。这纯粹是,英雄所见略同!脱离场景谈用量就是耍流氓嘛。在”为应用定义的云“这个理念下,我们正在努力构建以应用为核心的云操作系统。所以,今天的报告拆解重点就是:应用。看看Hyperion到底讲了点啥:Cloud HPC市场增幅为HPC本地市场的2.4倍HPC总市场收入每100元中有14.6元属于应..
2022-02-18 16:07:57
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原创 老板带头反内卷,阿尔卑斯滑雪团建。。。别错过这一波上车机会
大家好!又到了两年多一度给大家汇报公司动态的时候了。(哈??曾经在#我们和老板的日常#里记录的光头大佬陈老板。好消息是,肌肉量持续稳定;坏消息是,发量也持续稳定。时常不经意间出现在我们故事线里的卡总,他月半了!红包现在也不怎么发了!!!出去为我们公司代言也变少了!(毕竟前浪嘛我们依然在做一件很酷又很难的事情,甚至有了一些跟随者。很难,很有意思。关于芯片设计、新药研发、智能制造,人工智能,我们懂的比过去多了一些。构建以应用为核心的云操作系统,对我..
2022-01-21 14:46:42
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原创 【11.18三星SAFE论坛】半导体圈内人高端局,群星云集,就差你了
2021年11月18日北京时间上午9时Samsung FoundrySAFE™ Forum 2021速石科技最帅资深架构师万山青Cyan江湖都听过他的传说~这场半导体圈内人的高端局包括多场BOSS级别主题演讲和约80场技术会议覆盖知识产权、EDA、云计算、设计服务、封装等多个领域的最新进展还有哪些大佬同台表演——Samsung Foundry代工业务高级副总裁 Ryan LeeArm CEO Simon SegarsANSY...
2021-11-16 14:07:47
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原创 CAE云实证Vol.11:这样跑COMSOL,是不是就可以发Nature了
说起多物理场仿真,必然绕不开COMSOL Multiphysics。不局限于究竟是哪种物理场,不局限于物理场之间如何实现耦合。COMSOL提供统一的数值仿真平台,使用相同的操作界面和工作流进行不同类型的数值仿真,可以说十分优秀了。从1998年发布首个版本至今,COMSOL一直在持续进化,如今它已经有了30多个针对不同应用领域的专业模块,涵盖力学、电磁场、流体、传热、化工、MEMS、声学等专业学科,并可以将不同的物理问题关联起来,方便研究不同物理过程之间的相互作用。越来越多Natu
2021-10-28 14:58:41
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原创 这一届科研计算人赶DDL红宝书:学生篇
打开百度APP看高清图片问:实验室的硬件条件好坏对你的科研有多大影响?答:啥条件都行,没有影响。我们坚信以下三点:1、科学家就是专门负责搞科研的;2、不依赖别人,你的研究效率和节奏必须掌握在你自己手里;3、不管是尝试有风险的新颖项目,还是运用深度学习手段,科研多试错才能出好东西。有老师跟我们吐槽说,一天天地忙着维护环境,整得跟运维工程师一样了,太耽误事儿。想找学生帮忙吧,他们很多也不懂啊~老师们的硕博后们也苦不堪言,本专业要学的东西已经多到爆炸,又要理论还要搞实验,还..
2021-09-09 11:18:54
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原创 缺人!缺钱!赶时间!初创IC设计公司如何“绝地求生”?
过去2-3年,半导体行业初创公司如雨后春笋般冒出来。有从大企业团队独立出来创建的新芯片设计公司,有来自海内外高校和科研机构的商业化项目,甚至还有跨界公司专门成立了一个较小的芯片部门试水,希望快速出结果。我们对IC设计初创公司的定义:1、成立时间0-2年2、还没有IPO上市3、已经或即将获得新一轮融资4、拥有独特的技术和较强芯片研发能力5、本地没有机房,没有服务器,或者就几台6、公司规模0-50人初创IC公司手里的三张牌初创公司的优势在于,没有历史包..
2021-08-25 10:55:46
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原创 杨洋组织的“太空营救”中,那2小时到底发生了什么?
最近,航天界居然被一部都市爱情剧刷屏了。在《你是我的荣耀》这部剧中,杨洋饰演的男主于途是一个心怀梦想的航天设计师。在前往西北卫星测控中心抢救JX-1号卫星的剧情里,涉及到了大量的航天专业知识。当中心领导脱口而出:“赶紧做仿真验证”,瞬间触发我这颗新生代农民工雷达:开多少核?要做多久?要排队吗?来得及吗?要上云吗?……错了,是这张:仿真立功!卫星拯救大作战事情是这样的:卫星发射之后,需要时不时地给地面发射信号,报告自己的状态。但是...
2021-08-18 11:18:14
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原创 EDA云实证Vol.10:Auto-Scale这支仙女棒如何大幅提升Virtuoso仿真效率?
这是我们EDA云实证的第四期。本期实证的主角是——Virtuoso。半导体行业中使用范围最广的EDA应用之一。1991年Virtuoso技术正式发布,最初作为掩模设计师的版图工具,是Opus平台的一部分,主要功能包括电路设计与仿真、版图设计、设计验证,以及模拟/数字混合设计等。近30年来,Virtuoso产品已和最初有很大不同,但其核心仍然是版图编辑器。应用工具层面。Cadence一直致力于优化EDA应用算法和性能,提高自动化水平,将Virtuoso逐渐升级和扩展为集合多项新..
2021-08-11 15:04:35
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原创 速石科技获元禾璞华领投数千万美元B轮融资,打造为应用定义的云
速石科技近日宣布完成数千万美元B轮融资,本轮由元禾璞华领投,Mirae Asset、凯辉基金、金沙江创投及华岩资本等各家老股东继续跟投,其中凯辉基金为A+轮领投方。本轮资金将主要用于进一步深化打造速石科技新一代为应用定义的云平台。速石科技成立于2017年,专注于从应用出发,为企业提供开箱即用的海量数据计算平台,解决企业应用上云以及多云使用中突出的效率、成本、复杂性问题,为企业提供高效可靠的一站式研发环境,实现用户对本地和多家公有云资源无差别访问,帮助用户提升10-20倍业务效率,加快市场响应速度。..
2021-07-29 15:38:42
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原创 速石科技获得“2021年度亚马逊云科技APN半导体行业核心合作伙伴”奖
7月21日,2021年亚马逊云科技中国峰会上海站盛大开幕,速石科技获得“2021年度APN半导体行业核心合作伙伴”奖项,该奖项旨在鼓励在半导体行业有突出贡献的合作伙伴。本次峰会上获此殊荣的企业仅速石科技一家。APN是亚马逊云科技推出的全球合作伙伴计划,该计划为合作伙伴提供系统化的技术、市场以及销售层面的支持,从而帮助合作伙伴同亚马逊云科技的软件生态持续发展。速石科技与亚马逊云科技有着良好的合作基础与丰富的合作经验。2020年,速石科技已经成为亚马逊云科技认证的高级技术合作伙伴(Advanced Tec.
2021-07-28 11:31:26
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原创 AI太笨了……暂时
我们在今年年初的文章【2021版】全球44家顶尖药企AI辅助药物研发行动白皮书里有聊到,对于AI,我们的判断是现在主要还集中“人工”的部分,而不是“智能”。但CADD(计算机辅助药物研发)/AI通常可以支持达到或选择这些药物研发工作的“更好”起点。a16z的Vijay Pande博士在上周写的文章《AI is Too Dumb… For Now》,同样认为现阶段的AI还是太“笨”了。如果人工智能不能变得比现在“聪明”很多,它在生物领域的潜力将是有限的。Vijay Pande博士,a16z普通合伙人,..
2021-06-25 11:03:19
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原创 速石科技成三星Foundry国内首家SAFE™云合作伙伴,助力中国半导体产业发展
速石科技(fastone)近日宣布,正式成为Samsung Foundry国内首家 SAFE™(Samsung Advanced Foundry Ecosystem,以下均称SAFE ™)云合作伙伴,共同打造一站式IC设计云平台,为广大中国用户和生态合作伙伴提供即开即用的云端芯片设计平台。双方将在产品打造、行业生态及市场合作层面深度合作,共同助力中国半导体行业飞速发展。SAFE™计划于2018年推出,旨在确保Samsung Foundry、生态系统合作伙伴和客户之间的深度合作,交付强大且极具竞争力的片上
2021-06-09 18:22:45
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原创 Ansys最新报告找到阻碍仿真效率提升“元凶”,竟然是……
工业仿真软件大佬Ansys又出报告了。主题是研究高性能计算在工程仿真中的应用情况。调研委托Peerless Research Group进行,包括仿真研发和设计工程师、工程经理、IT经理和高管,一共747人。老规矩,先看几个重要结论——缩短设计周期是一半以上用户在工作中面临的最大挑战;超过五分之一的人表示,他们最重要、最频繁的仿真必须通宵运行至少9至48个小时以上(2014年为近四分之一);由于周转时间的限制,大约三分之一的人降低了几乎所有模型的大小或精确度;使用云资源的人越来越多。超过四分.
2021-05-27 11:46:37
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原创 CAE云实证Vol.8:LS-DYNA求解效率深度测评 │ 六种规模,本地VS云端5种不同硬件配置
LS-DYNA是一个以显式求解为主,隐式求解为辅的通用非线性动力有限元分析程序,核心是求解器。用户主要是高校/科研机构和航空航天、汽车、电子/高科技、船舶、土木工程、制造和生物工程等行业,包括汽车碰撞、爆炸反应,甚至主动脉人工心脏瓣膜在血液泵送通过时的复杂启闭行为。1976年,LS-DYNA由美国Lawrence Livermore国家实验室的J.O.Hallquist博士主持开发。1988年,LSTC(Livermore Software Technology Corp.)公司成立,LS-DYNA开.
2021-04-28 16:36:27
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原创 EDA云实证Vol.7:揭秘20000个VCS任务背后的“搬桌子”系列故事
新思科技(Synopsys)家的VCS,在半导体行业使用率极高,背景我们就不多说了。对经常跑EDA或其他算力密集型任务的用户来说,在深度掌握本行业业务知识及熟练运用常见EDA工具以外,通常还需要在技能树上点上一门技能——IT,就是怎么(顺利)使用机器把手里的任务给(高效)跑完。他们的IT技能升级打怪之旅一般分为三个阶段:第一阶段:单机单CPU核,单任务第二阶段:单机多CPU核,多任务第三阶段:多机多CPU核,多任务据我们观察,很多用户都已经处在第二阶段。但是,依然有部分用户尚处在第一阶段,.
2021-03-26 16:18:12
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原创 2小时,账单47万!「Milkie Way公司破产未遂事件」复盘分析
2019年11月,Milkie Way公司开始开发一个叫Announce的产品。2020年3月,这家初创公司就差点儿破产关门。一个云上的小测试项目,使用了数据库和Serverless服务,几个小时,在1000个实例上进行了1160亿次读取和3300万次写入,他们不小心烧掉了将近72000 美元(折合人民币约47万元)!EXO ME ???????我们大概讲过一万次(bushi):用户用云是有一定的学习成本和难度的。在应用和基础架构,加上丰富多样的云产品和服务之间,是存在GAP的。但一直没有合适的.
2021-03-19 10:45:09
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原创 高情商:人类世界模拟器是真的!低情商:你是假的……
全球第一带货王马斯克认为:有0.999999999的可能性,我们都是活在计算机仿真模拟世界里的角色。你可以简单粗暴地理解为,我们被“模拟人生”了。牛津大学教授Nick Bostrom表示不服。他在2003年认真写了一篇论文里讨论这种可能性,并且认为:不,我们只有20%的可能性是被仿真模拟的。另外两种可能性是:1、人类在掌握模拟自己这种高能技术之前已经灭绝了。可能是因为全球变暖之类的,但更可能的是我们滥用了自己发明的技术——比如能自我复制的纳米机器人本质上是一种机械细菌,然后它们杀死了全人类。.
2021-02-24 10:34:20
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原创 告别2020:Cloud HPC的征途,literally,是星辰大海呀
HPC-in-the-cloud is now a thing – not a soon-to-be thing.By John RussellSenior Editor of HPCwire模拟银河,了解暗物质的运动和形成优化海洋模型,提供气候预测Literally,Cloud HPC的征途,是星辰大海啊去年,我们暴风哭泣,云端高性能计算终于有了姓名。今年,在Hyperion Research的年度HPC市场报告里,Cloud HPC正式拥有了席位。就像HPC wire主编John ...
2021-02-05 10:12:55
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原创 「2021版」全球44家顶尖药企AI辅助药物研发行动白皮书
40年后的今天,我们看看全球顶尖药企用人工智能辅助新药研发到底应用到什么状态和阶段了。“别看他的眼睛,你看他的手。”—— 用钱投票才是最真实的。坦率地说,我们离靠计算机发现药物,然后通过一大堆机器人试验对药物进行虚拟测试,只要单击几下鼠标就可以将它们送给患者的世界相距甚远。AI中没有魔术,只有概率和统计。利用计算机/人工智能辅助药物研发,拆解一下:“人工”,是通过计算能力更快地试,更精确地建模模拟;“智能”,是从大量优质数据、经验中自行学习,给结果,就像一个新药研发人员,并不需要学习他
2021-01-20 10:28:57
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原创 生信云实证Vol.6:155个GPU!多云场景下的Amber自由能计算
在上一篇生信云实证里,我们基于不同用户策略,调用10万核CPU资源,帮用户进行了2800万量级的大规模分子对接,将运算效率提高2920倍。对药物分子的虚拟筛选,仅仅实现分子对接是不够的,往往会面临一个问题就是药物分子活性的评价。许多药物和其它生物分子的活性都是通过与受体大分子之间的相互作用表现出来的,是动态的。受体和配体之间结合自由能(Binding Afinity)评价是基于结构的计算机辅助药物分子设计的核心问题。基于分子动力学(Molecular Dynamics, MD)模拟的炼金术.
2021-01-08 10:46:05
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原创 ICCAD观后感|EDA云平台49问
“我聊的每一个人都表示对云感兴趣,所以我觉得现在的问题在于什么时候上云,而不在于上不上云这件事。”—Cadence 云业务开发VP (DAC 2019)去年9月在DAC(Design Automation Conference)大会之后,我们制作了一个全球半导体行业上云格局一览图,然后得出了两个结论:整个半导体产业链核心角色:EDA厂商/ Foundry/Fabless无一缺席,都已经开始上云的步伐;全球各大云厂商不仅积极拥抱半导体产业,甚至自己主导设计开发芯片,在产业链中扮演双重角色。
2020-12-18 10:56:00
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原创 CAE云实证Vol.5:怎么把需要45天的突发性Fluent仿真计算缩短到4天之内?
**CFD(Computational Fluid Dynamics,计算流体动力学)**是一种利用计算机来解决工程流体流动问题的方法,具体方法是数值计算,通过计算机求解流体流动过程中的质量传递、能量传递、动量传递以及化学反应问题,不受物理模型和实验模型的限制,省钱省时,可以模拟真实条件和实验中很难达到的理想条件。**Fluent算得上应用最广泛的CFD应用了。**2006年5月,正式成为Ansys大家庭中的重要成员,共享先进的Ansys公共CAE技术。数值计算方法有几个难点:1、很大程度上依赖于经.
2020-12-02 10:41:56
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原创 EDA云实证Vol.4:国内最大规模OPC上云,5000核并行,效率提升53倍
之前我们曾帮一家Design House提高了使用HSPICE进行芯片设计仿真的效率。而设计好的集成电路图案需要通过光刻机转印到晶圆上才能完成制造,这就是芯片制造中最重要的一个步骤——光刻。在先进工艺特别是 FinFET 工艺中,计算光刻已经成为光刻工艺研发的核心。光学邻近效应校正(Optical Proximity Correction,OPC)属于计算光刻技术的一种,主要是利用软件和高性能计算,来模拟仿真光刻过程中的光学和化学过程,通过仿真建立精确的计算模型,然后调整图形的边沿不断仿真迭代,直到.
2020-11-18 10:43:25
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